Bioinformatique : opportunités pour l’enseignement
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1Projet ESII Le numérique en biologie (Bioinformatique) : opportunités pour l’enseignement
Cette page peut être atteinte directement par http://tinyurl.com/bioinfoEduTechWiki ou http://unige.ch/-/bioinformatique
- Des activités en classe ou de type TP / laboratoire virtuel ou les élèves peuvent vérifier des hypothèses et construire des connaissances en se basant sur les savoirs les plus récents
- Des protocoles-élèves
- 1) Éprouver que la séquence du gène de quelques protéines est repérable sur les chromosomes humains.
- 2) Éprouver que la séquence du gène de quelques protéines est bien constituée de ATCG
- 3) Éprouver qu'une grande partie du génome n'est pas constituée de gènes
- 4) Éprouver que certains gènes sont constitués d'Introns et d'Exons
- 5) Éprouver que la limite introns-exons n'est pas discernable aisément
- 6) Éprouver que l'origine de réplication est une séquence de bases
- 7) Éprouver que les SNP sont fréquents et sont des changements d'une seule base par exemple dans le gène CFTR
- 8) Savoir choisir les sondes pour déterminer chaque SNP étudié dans une puce à ADN (µ-array)
- 9) Éprouver comment on pourrait choisir les sondes pour déterminer un SNP spécifique ( la ∂F508 cause la plus fréquente de la mucoviscidose) dans une puce à ADN (µ-array)
- 10) Éprouver que les séquences pour les empreintes (satellites) sont des séquences répétées
- 11) Comparer pour 3 personnes le nombre de répétitions dans un satellite sur le chr 1
- 12) Variante Former un schéma du gel pour une empreinte ADN à partir des séquences sur le chromosome 1 pour 3 personnes
- 13) Éprouver que l'extrémité des chromosomes humains sont constitués de télomères
- 14) Preuve de l'évolution par la comparaison de protéines chez différentes espèces
- 15 ) Déterminer la structure 3D d'une protéine biologiquement importante
- 16) Convertir la structure de la protéine en fichier pour imprimante 3D(.STL)
- 17) Peut-on prédire la répartition des espèces végétales à partir de mesures physicochimiques et des valeurs écologiques Landolt ? (et réciproquement ?)
- Des exemples de progressions possibles en articulant ces activités
- Des listes de questions pour guider les activités et les évaluations
- D'autres activités Bioinformatique @ SIB
- Des Liste de protéines sélectionnées, de structures 3D prêtes à imprimer
- Une sélection de sites pour les enseignants
- Des liens vers des sources d'information
- Sars-Cov2 et Covid :
- Suivi des souches du virus en fonction du lieu et du temps : Nextstrain, Real-time tracking of pathogen evolution
- Sars-Cov2 et Covid :