Bioinformatique : opportunités pour l’enseignement
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Projet ESII Le numérique en biologie (Bioinformatique) : opportunités pour l’enseignement
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- Des activités en classe ou de type TP / laboratoire virtuel ou les élèves peuvent vérifier des hypothèses et construire des connaissances en se basant sur les savoirs les plus récents
- Des protocoles-élèves
- 1) Éprouver que la séquence du gène de quelques protéines est repérable sur les chromosomes humains.
- 2) Éprouver que la séquence du gène de quelques protéines est bien constituée de ATCG
- 3) Éprouver qu'une grande partie du génome n'est pas constituée de gènes
- 4) Éprouver que certains gènes sont constitués d'Introns et d'Exons
- 5) Éprouver que la limite introns-exons n'est pas discernable aisément
- 6) Éprouver que les SNP sont fréquents et sont des changements d'une seule base par exemple dans le gène CFTR
- 7) Savoir choisir les sondes pour déterminer chaque SNP étudié dans une puce à ADN (µ-array)
- 8) Éprouver que les séquences pour les empreintes (satellites) sont des séquences répétées
- 9) Comparer pour 3 personnes le nombre de répétitions dans un satellite sur le chr 1
- 9b) Variante Former un schéma du gel pour une empreinte ADN à partir des séquences sur le chromosome 1 pour 3 personnes
- 10) Éprouver que l'extrémité des chromosomes humains sont constitués de télomères
- 11) Preuve de l'évolution par la comparaison de protéines chez différentes espèces
- Déterminer la structure 3D d'une protéine biologiquement importante
- Convertir la structure de la protéine en fichier pour imprimante 3D(.STL)
- Des exemples de progressions possibles en articulant ces activités
- Des listes de questions pour guider les activités et les évaluations
- Des fiches techniques pour les manipulations informatiques
- Des Liste de protéines sélectionnées, de structures 3D prêtes à imprimer,
- Une sélection de sites pour les enseignants