« Activités Bioinfo dans le chapitre génétique et biolo. moléculaire » : différence entre les versions
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*# [[Séquence du gène de protéines sur chromosomes|Éprouver que la séquence des gènes codant pour les protéines est repérable sur les chromosomes humains (quelques exemples).]] | |||
*# [[Séquence gène constituée ATCG|Éprouver que la séquence]] des gènes codant pour les protéines est bien constituée de ATCG (quelques exemples) | |||
*# [[Génome pas constitué de gènes seulement|Éprouver qu'une grande partie du génome n'est pas constituée de gènes]] | |||
*# [[Gènes constitués d'Introns et d'Exons|Éprouver que beaucoup de gènes sont constitués d'Introns et d'Exons]] | |||
*# [[Limite introns-exons pas discernable|Éprouver que la limite introns-exons n'est pas discernable aisément]] | |||
*# [[Éprouver que l'origine de réplication est une séquence de bases|Éprouver que l'origine de transcription est une séquence de bases]] | |||
*# [[SNP fréquents - changements d'une seule base|Éprouver que les SNP sont fréquents et sont des changements d'une seule base par exemple dans le gène CFTR]] | |||
*# [[Choisir les sondes pour tester SNP sur micro-array|Savoir choisir les sondes pour déterminer chaque SNP étudié dans une puce à ADN (µ-array)]] | |||
*# [[Choisir les sondes pour déterminer un SNP spécifique dans une puce à ADN (µ-array)|Éprouver comment on pourrait choisir les sondes pour déterminer un SNP spécifique ( la ∂F508 cause la plus fréquente de la mucoviscidose) dans une puce à ADN (µ-array)]] | |||
*# [[Estimer la taille minimale permettant de retrouver spécifiquement une séquence.|Estimer la taille minimale permettant de retrouver spécifiquement une séquence.]] | |||
*# [[Les séquences pour les empreintes (satellites) sont des séquences répétées|Éprouver que les séquences pour les empreintes (satellites) sont des séquences répétées]] | |||
*# [[Comparer pour 3 personnes le nombre de répétitions dans un satellite sur le chr 1]] | |||
*# [[Former un schéma du gel pour une empreinte ADN à partir des séquences répétées|Variante Former un schéma du gel pour une empreinte ADN à partir des séquences sur le chromosome 1 pour 3 personnes]] | |||
*# [[L'extrémité des chromosomes constitués de télomères|Éprouver que l'extrémité des chromosomes humains sont constitués de télomères]] | |||
*# [[Déterminer les organes exprimant un gène donné|Déterminer les tissus et organes exprimant un gène (humain) donné]] | |||
*# [[Expression d'un gène selon les organes au cours de l'embryogenèse|Déterminer le degré d'expression d'un gène selon les organes au cours de l'embryogenèse (souris)]] | |||
*# [[Preuve de l'évolution par la comparaison de protéines chez différentes espèces]] | |||
*# [[Déterminer la structure 3D d'une protéine biologiquement importante|Déterminer la structure 3D d'une protéine biologiquement importante]] | |||
*#* [http://tecfa.unige.ch/perso/lombardf/formcont/proteines-3D/exemples-pdb-to-stl/ Liste de protéines sélectionnées, de structures 3D prêtes à imprimer] | |||
*# [[Convertir la structure de la protéine en fichier pour imprimante 3D]](.STL) | |||
*# [[Éprouver le lien entre structure, séquence et fonction d'une protéine]] | |||
*# [[Prédire la répartition des espèces à partir de mesures et des valeurs écologiques ?|Peut-on prédire la répartition des espèces végétales à partir de mesures physicochimiques et des valeurs écologiques Landolt ? (et réciproquement ?)]] | |||
*# [[Eprouver le rôle central des protéines dans le fonctionnement normal et la maladie|Éprouver le rôle central des protéines dans le fonctionnement normal et la maladie]] | |||
*# [[Trouver des séquences virales dans le génome humain]] (En cours de rédaction) | |||
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Version du 10 février 2021 à 18:56
Génétique et biologie moléculaire : insertions possibles des activités de biologie numérique
-
- Éprouver que la séquence des gènes codant pour les protéines est repérable sur les chromosomes humains (quelques exemples).
- Éprouver que la séquence des gènes codant pour les protéines est bien constituée de ATCG (quelques exemples)
- Éprouver qu'une grande partie du génome n'est pas constituée de gènes
- Éprouver que beaucoup de gènes sont constitués d'Introns et d'Exons
- Éprouver que la limite introns-exons n'est pas discernable aisément
- Éprouver que l'origine de transcription est une séquence de bases
- Éprouver que les SNP sont fréquents et sont des changements d'une seule base par exemple dans le gène CFTR
- Savoir choisir les sondes pour déterminer chaque SNP étudié dans une puce à ADN (µ-array)
- Éprouver comment on pourrait choisir les sondes pour déterminer un SNP spécifique ( la ∂F508 cause la plus fréquente de la mucoviscidose) dans une puce à ADN (µ-array)
- Estimer la taille minimale permettant de retrouver spécifiquement une séquence.
- Éprouver que les séquences pour les empreintes (satellites) sont des séquences répétées
- Comparer pour 3 personnes le nombre de répétitions dans un satellite sur le chr 1
- Variante Former un schéma du gel pour une empreinte ADN à partir des séquences sur le chromosome 1 pour 3 personnes
- Éprouver que l'extrémité des chromosomes humains sont constitués de télomères
- Déterminer les tissus et organes exprimant un gène (humain) donné
- Déterminer le degré d'expression d'un gène selon les organes au cours de l'embryogenèse (souris)
- Preuve de l'évolution par la comparaison de protéines chez différentes espèces
- Déterminer la structure 3D d'une protéine biologiquement importante
- Convertir la structure de la protéine en fichier pour imprimante 3D(.STL)
- Éprouver le lien entre structure, séquence et fonction d'une protéine
- Peut-on prédire la répartition des espèces végétales à partir de mesures physicochimiques et des valeurs écologiques Landolt ? (et réciproquement ?)
- Éprouver le rôle central des protéines dans le fonctionnement normal et la maladie
- Trouver des séquences virales dans le génome humain (En cours de rédaction)