« Bioinformatique : opportunités pour l’enseignement » : différence entre les versions
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===== D'autres activités proposées par le SIB Institut Suisse de Bioinformatique ===== | ===== D'autres [http://education.expasy.org/bioinformatique/ activités proposées par le SIB Institut Suisse de Bioinformatique] ===== | ||
** [http://education.expasy.org/bioinformatique/Atelier1.html Des chromosomes et des gènes] | ** [http://education.expasy.org/bioinformatique/Atelier1.html 22. Des chromosomes et des gènes] | ||
** [http://education.expasy.org/bioinformatique/Atelier2.html Protéines et Drug Design] | ** [http://education.expasy.org/bioinformatique/Atelier2.html 23. Protéines et Drug Design] | ||
** [http://education.expasy.org/bioinformatique/Atelier3.html Phylogénie, biodiversité et pizza | ** [http://education.expasy.org/bioinformatique/Atelier3.html 24. Phylogénie, biodiversité et pizza ...] | ||
** [http://education.expasy.org/bioinformatique/pdfs/A_vous_de_jouer.pdf Médecine de précision et profil génétique] | *** [http://education.expasy.org/bioinformatique/PizzaMetagenomic.html Pizza métagénomqiue] | ||
** [http://education.expasy.org/bioinformatique/Coronavirus_proteines.html Coronavirus et protéines...] | ** [http://education.expasy.org/bioinformatique/pdfs/A_vous_de_jouer.pdf 25. Médecine de précision et profil génétique] | ||
** [http://education.expasy.org/bioinformatique/Atelier6.html Découverte de BLAST...] | ** [http://education.expasy.org/bioinformatique/Coronavirus_proteines.html 26. Coronavirus et protéines...] | ||
** [http://education.expasy.org/bioinformatique/journee_diabete_3.html L'insuline de A à Z] | *** [http://education.expasy.org/bioinformatique/pdfs/Bioinfo_corona_vs11.pdf#page=45 Origine du nouveau coronavirus SARS-CoV-2] | ||
** [http://education.expasy.org/bioinformatique/Liens.html Quelques liens pour les plus curieux]...... | ** [http://education.expasy.org/bioinformatique/Atelier6.html 27. Découverte de BLAST...] | ||
** [http://education.expasy.org/bioinformatique/gout_amer.html La génétique d'un goût amer...]@ SIB | ** [http://education.expasy.org/bioinformatique/journee_diabete_3.html 28. L'insuline de A à Z] | ||
** [http://education.expasy.org/bioinformatique/Liens.html 29. Quelques liens pour les plus curieux]...... | |||
*** [http://education.expasy.org/bioinformatique/gout_amer.html La génétique d'un goût amer...]@ SIB | |||
===== Une sélection de sites pour les enseignants ===== | ===== Une sélection de sites pour les enseignants ===== | ||
* Des | * Des listes de protéines sélectionnées, de structures 3D prêtes à imprimer | ||
===== Des liens vers des sources d'information ===== | ===== Des liens vers des sources d'information ===== | ||
** | ** SARS-CoV-2 et COVID-19 : | ||
*** Suivi des souches du virus en fonction du lieu et du temps : [https://nextstrain.org/ncov/global Nextstrain.org, Real-time tracking of pathogen evolution] | *** Suivi des souches du virus en fonction du lieu et du temps : [https://nextstrain.org/ncov/global Nextstrain.org, Real-time tracking of pathogen evolution] | ||
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[[Catégorie: BioInfoScenarios]] | [[Catégorie: BioInfoScenarios]] | ||
Version du 26 octobre 2020 à 08:56
1Projet ESII Le numérique en biologie (Bioinformatique) : opportunités pour l’enseignement
Cette page peut être atteinte directement par http://tinyurl.com/bioinfoEduTechWiki ou http://unige.ch/-/bioinformatique
- Des activités en classe ou de type TP / laboratoire virtuel ou les élèves peuvent vérifier des hypothèses et construire des connaissances en se basant sur les savoirs les plus récents
Des protocoles-élève
- Éprouver que la séquence des gènes codant pour les protéines est repérable sur les chromosomes humains (quelques exemples).
- Éprouver que la séquence des gènes codant pour les protéines est bien constituée de ATCG (quelques exemples)
- Éprouver qu'une grande partie du génome n'est pas constituée de gènes
- Éprouver que beaucoup de gènes sont constitués d'Introns et d'Exons
- Éprouver que la limite introns-exons n'est pas discernable aisément
- Éprouver que l'origine de réplication est une séquence de bases
- Éprouver que les SNP sont fréquents et sont des changements d'une seule base par exemple dans le gène CFTR
- Savoir choisir les sondes pour déterminer chaque SNP étudié dans une puce à ADN (µ-array)
- Éprouver comment on pourrait choisir les sondes pour déterminer un SNP spécifique ( la ∂F508 cause la plus fréquente de la mucoviscidose) dans une puce à ADN (µ-array)
- Estimer la taille minimale permettant de retrouver spécifiquement une séquence.
- Éprouver que les séquences pour les empreintes (satellites) sont des séquences répétées
- Comparer pour 3 personnes le nombre de répétitions dans un satellite sur le chr 1
- Variante Former un schéma du gel pour une empreinte ADN à partir des séquences sur le chromosome 1 pour 3 personnes
- Éprouver que l'extrémité des chromosomes humains sont constitués de télomères
- Déterminer les tissus et organes exprimant un gène (humain) donné
- Déterminer le degré d'expression d'un gène selon les organes au cours de l'embryogenèse (souris)
- Preuve de l'évolution par la comparaison de protéines chez différentes espèces
- Déterminer la structure 3D d'une protéine biologiquement importante
- Des Liste de protéines sélectionnées, de structures 3D prêtes à imprimer
- Convertir la structure de la protéine en fichier pour imprimante 3D(.STL)
- Éprouver le lien entre structure, séquence et fonction d'une protéine
- Peut-on prédire la répartition des espèces végétales à partir de mesures physicochimiques et des valeurs écologiques Landolt ? (et réciproquement ?)
Des exemples de progressions possibles en articulant ces activités
Des listes de questions pour guider les activités et les évaluations
Encore en rédaction
D'autres activités proposées par le SIB Institut Suisse de Bioinformatique
Une sélection de sites pour les enseignants
- Des listes de protéines sélectionnées, de structures 3D prêtes à imprimer
Des liens vers des sources d'information
- SARS-CoV-2 et COVID-19 :
- Suivi des souches du virus en fonction du lieu et du temps : Nextstrain.org, Real-time tracking of pathogen evolution
- SARS-CoV-2 et COVID-19 :