SNP fréquents - changements d'une seule base
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Éprouver que les SNP sont fréquents et sont des changements d'une seule base par exemple dans le gène CFTR
Procédure
Ouvrir Genome data Viewer GDV ici
Préalable trouver une séquence d'un gène : Séquence du gène de protéines sur chromosomes
- Afficher la séquence d'une protéine à choix : p. ex CFTR
- [Solution]
- Si nécessaire zoomer à la séquence (icone ATG),
- Observer les SNP en bleu noter leur fréquence
- En choisir un (par exemple rs1228922204)
- -> cliquer sur le SNP choisi,
- ou le chercher en introduisant son identifiant dans la case searhc assembl en haut à gauche [solution] valable 90 jours depuis le 25.09.22
- Repérer la base qui change T<->C dans ce cas
Ce qu'on peut obtenir : p. ex, synthèse par un élève des résultats avec une classe
Scénarios pédagogiques où il peut s'intégrer
[1]Afin d'aider les élèves à imaginer ce qu'est un SNP, pourrait précéder :
Références
Scénario établi en partie sur la base des indications scientifiques de M.-C. Blatter du SIB