Activités Bioinfo dans le chapitre Physiologie

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Physiologie : insertions possibles des activités de biologie numérique

  • Les élèves ont de la difficulté à faire le lien entre la séquence d'a.a., et la structure de la protéine. Les modèles illustrés sont très différents et ils n'ont pas l'expertise de l'enseignant qui sait utiliser le bon modèle au bon moment : le lien entre structure, séquence et fonction d'une protéine Scénario ici
    • Exemples :
    • Hémoglobine
      Hemoglobine-3D-2hhb.jpg
      quand on étudie la respiration, les rôles de la circulation, les échanges gazeux, …
    • ATPase
      ATP synthase 3D printed.jpg
      quand on étudie la respiration cellulaire
    • Le récepteur au neurotransmetteur Acetylcholine
      2bg9 acétycholine-Receptor.jpg
      quand on étudie la synapse,
      • par analogie avec d'autres récepteurs lorsqu'on étudie les drogues
      • par analogie avec les canaux ioniques dans l'influx nerveux, etc.
  • Les élèves ont de la difficulté à faire le liens attendus entre des représentions très différentes : la séquence d'a.a., et sa fonction. Comment les aider à savoir prédire / expliquer les effets d'une mutation de la séquence sur le fonctionnement de la protéine (Mucoviscidose, Anémie falciforme) : Scénario ici
  • Les élèves ont de la peine à utiliser une représentation de la structure d'une protéine pour expliquer/ prédire les interactions de son site actif. P. ex hormone, enzyme, transmembranaire, anticorps, … . Scénario ici
  • Cas9-5F9R-crispr-model 3D.jpg
    CRISPR-Cas-9 : Les interactions complexes entre ARNGuide, ADN, et Cas9 sont difficiles à visualiser à partir de seules images 2D. Manipuler des modèles 3D de la protéine Cas9, l'ADN et l'ARN peut rendre plus concret et aider certains élèves  : Scénario ici

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