« Activités Bioinfo dans le chapitre Physiologie » : différence entre les versions

De EduTech Wiki
Aller à la navigation Aller à la recherche
(formulation à partir des avantages pour les élèves)
mAucun résumé des modifications
Ligne 1 : Ligne 1 :
== Physiologie : insertions possibles des activités de biologie numérique ==
== Physiologie : insertions possibles des activités de biologie numérique ==


* Les élèves ont de la difficulté à faire le lien entre la séquence d'a.a., et la structure de la protéine. les modèles illustrés sont très différents et ils n'ont pas l'expertise de l'enseignant qui sait utiliser le bon modèle au bon moment :  le lien entre structure, séquence et fonction d'une protéine [[Éprouver le lien entre structure, séquence et fonction d'une protéine|Scénario ici]]
* Les élèves ont de la difficulté à faire le lien entre la séquence d'a.a., et la structure de la protéine. Les modèles illustrés sont très différents et ils n'ont pas l'expertise de l'enseignant qui sait utiliser le bon modèle au bon moment :  le lien entre structure, séquence et fonction d'une protéine [[Éprouver le lien entre structure, séquence et fonction d'une protéine|Scénario ici]]
* Les élèves ont de la difficulté à faire le liens attendus entre des représentions très différentes : la séquence d'a.a., et sa fonction. Comment les aider à savoir prédire / expliquer les effets d'une mutation de la séquence sur le fonctionnement de la protéine ( Mucoviscidose, Anémie falciforme) :  [[Éprouver le lien entre structure, séquence et fonction d'une protéine|Scénario ici]]
** Exemples :
** Hémoglobine quand on étudie la respiration, les rôles de la circulation, les échanges gazeux, …
** ATPase quand on étudie la respiration cellulaire
** Le récepteur au neurotransmetteur Acetylcholine quand on étudie la synapse,
*** par analogie avec d'autres récepteurs lorsqu'on étudie les drogues
*** par analogie avec les canaux ioniques dans l'influx nerveux,  etc.
* Les élèves ont de la difficulté à faire le liens attendus entre des représentions très différentes : la séquence d'a.a., et sa fonction. Comment les aider à savoir prédire / expliquer les effets d'une mutation de la séquence sur le fonctionnement de la protéine (Mucoviscidose, Anémie falciforme) :  [[Éprouver le lien entre structure, séquence et fonction d'une protéine|Scénario ici]]
* Les élèves ont de la peine à utiliser une représentation de la structure d'une protéine pour expliquer/ prédire les interactions de son site actif. P. ex hormone, enzyme, transmembranaire, anticorps, … . [[Déterminer la structure 3D d'une protéine biologiquement importante|Scénario ici]]  
* Les élèves ont de la peine à utiliser une représentation de la structure d'une protéine pour expliquer/ prédire les interactions de son site actif. P. ex hormone, enzyme, transmembranaire, anticorps, … . [[Déterminer la structure 3D d'une protéine biologiquement importante|Scénario ici]]  
* CRISPR-Cas-9 : Les interactions complexes entre ARNGuide, ADN, et Cas9 sont difficiles à visualiser  à partir de seules images 2D. Manipuler des modèles 3D de la protéine Cas9,  l'ADN et l'ARN peut rendre plus concret et aider certains élèves  :  [[Prédire la répartition des espèces à partir de mesures et des valeurs écologiques ?|Scénario ici]]  
* CRISPR-Cas-9 : Les interactions complexes entre ARNGuide, ADN, et Cas9 sont difficiles à visualiser  à partir de seules images 2D. Manipuler des modèles 3D de la protéine Cas9,  l'ADN et l'ARN peut rendre plus concret et aider certains élèves  :  [[Prédire la répartition des espèces à partir de mesures et des valeurs écologiques ?|Scénario ici]]  
* Les interactions entre anticorps, antigène sont difficiles à visualiser  par les élèves (notamment poche antigénique, épitope,…). Manipuler des modèles 3D de la protéine IgG et de modèles de pathogènes hérissés d'objets magnétiques (petits clous par exemple) peut rendre plus concret ces interactions et aider certains élèves  :  [[Prédire la répartition des espèces à partir de mesures et des valeurs écologiques ?|Scénario ici]]
* Intégrer comment la bivalence des Anticorps  : des antigènes (épitopes plus précisément) représentés par des clous plantés dans des modèles de virus ou bactéries (en sagex ou en bois) peuvent rendre plus concret ces interactions et aider certains élèves  :  [[Déterminer la structure 3D d'une protéine biologiquement importante|Scénario ici]]


Retour à  [[Bioinformatique : opportunités pour l’enseignement]]
Retour à  [[Bioinformatique : opportunités pour l’enseignement]]
[[Catégorie: BioInfoScenarios]]
[[Catégorie: BioInfoScenarios]]

Version du 9 mars 2021 à 11:53

Physiologie : insertions possibles des activités de biologie numérique

  • Les élèves ont de la difficulté à faire le lien entre la séquence d'a.a., et la structure de la protéine. Les modèles illustrés sont très différents et ils n'ont pas l'expertise de l'enseignant qui sait utiliser le bon modèle au bon moment : le lien entre structure, séquence et fonction d'une protéine Scénario ici
    • Exemples :
    • Hémoglobine quand on étudie la respiration, les rôles de la circulation, les échanges gazeux, …
    • ATPase quand on étudie la respiration cellulaire
    • Le récepteur au neurotransmetteur Acetylcholine quand on étudie la synapse,
      • par analogie avec d'autres récepteurs lorsqu'on étudie les drogues
      • par analogie avec les canaux ioniques dans l'influx nerveux, etc.
  • Les élèves ont de la difficulté à faire le liens attendus entre des représentions très différentes : la séquence d'a.a., et sa fonction. Comment les aider à savoir prédire / expliquer les effets d'une mutation de la séquence sur le fonctionnement de la protéine (Mucoviscidose, Anémie falciforme) : Scénario ici
  • Les élèves ont de la peine à utiliser une représentation de la structure d'une protéine pour expliquer/ prédire les interactions de son site actif. P. ex hormone, enzyme, transmembranaire, anticorps, … . Scénario ici
  • CRISPR-Cas-9 : Les interactions complexes entre ARNGuide, ADN, et Cas9 sont difficiles à visualiser à partir de seules images 2D. Manipuler des modèles 3D de la protéine Cas9, l'ADN et l'ARN peut rendre plus concret et aider certains élèves  : Scénario ici

Retour à Bioinformatique : opportunités pour l’enseignement