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== Physiologie : insertions possibles des activités de biologie numérique ==
== Physiologie : insertions possibles des activités de biologie numérique ==


* Comment éprouver un concept fondamental en physiologie et qu'il est difficile de traiter en classe :  le lien entre structure, séquence et fonction d'une protéine [[Éprouver le lien entre structure, séquence et fonction d'une protéine|Scénario ici]]
* Les élèves ont de la difficulté à faire le lien entre la séquence d'a.a., et la structure de la protéine. les modèles illustrés sont très différents et ils n'ont pas l'expertise de l'enseignant qui sait utiliser le bon modèle au bon moment :  le lien entre structure, séquence et fonction d'une protéine [[Éprouver le lien entre structure, séquence et fonction d'une protéine|Scénario ici]]
* Comment aider les élèves à visualiser la forme d'une protéine ( hormone, enzyme, transmembranaire, immunologique, … ) et les interactions avec son site actif p. ex  . [[Déterminer la structure 3D d'une protéine biologiquement importante|Scénario ici]]  
* Les élèves ont de la difficulté à faire le liens attendus entre des représentions très différentes : la séquence d'a.a., et sa fonction. Comment les aider à savoir prédire / expliquer les effets d'une mutation de la séquence sur le fonctionnement de la protéine ( Mucoviscidose, Anémie falciforme) :  [[Éprouver le lien entre structure, séquence et fonction d'une protéine|Scénario ici]]
* Les interactions entre ARNGuide, ADN, et Cas9 Sont difficiles à visualiser  par les élèves :  [[Prédire la répartition des espèces à partir de mesures et des valeurs écologiques ?|Scénario ici]]  
* Les élèves ont de la peine à utiliser une représentation de la structure d'une protéine pour expliquer/ prédire les interactions de son site actif. P. ex hormone, enzyme, transmembranaire, anticorps, … . [[Déterminer la structure 3D d'une protéine biologiquement importante|Scénario ici]]  
* Les interactions entre anticorps, antigène ont difficiles à visualiser  par les élèves(voire poche antigénique, épitope,…) [[Prédire la répartition des espèces à partir de mesures et des valeurs écologiques ?|Scénario ici]]  
* CRISPR-Cas-9 : Les interactions complexes entre ARNGuide, ADN, et Cas9 sont difficiles à visualiser  à partir de seules images 2D. Manipuler des modèles 3D de la protéine Cas9,  l'ADN et l'ARN peut rendre plus concret et aider certains élèves :  [[Prédire la répartition des espèces à partir de mesures et des valeurs écologiques ?|Scénario ici]]  
* L'agglutination résultant de la bivalence des Anticorps : des Antigènes représentés par des clous plantés dans des modèles de bactéries (en sagex ou en bois)  [[Déterminer la structure 3D d'une protéine biologiquement importante|Scénario ici]]  
* Les interactions entre anticorps, antigène sont difficiles à visualiser  par les élèves (notamment poche antigénique, épitope,…). Manipuler des modèles 3D de la protéine IgG et de modèles de pathogènes hérissés d'objets magnétiques (petits clous par exemple) peut rendre plus concret ces interactions et aider certains élèves  :  [[Prédire la répartition des espèces à partir de mesures et des valeurs écologiques ?|Scénario ici]]  
* Intégrer comment la bivalence des Anticorps : des antigènes (épitopes plus précisément) représentés par des clous plantés dans des modèles de virus ou bactéries (en sagex ou en bois) peuvent rendre plus concret ces interactions et aider certains élèves  :   [[Déterminer la structure 3D d'une protéine biologiquement importante|Scénario ici]]  


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Version du 26 février 2021 à 10:32

Physiologie : insertions possibles des activités de biologie numérique

  • Les élèves ont de la difficulté à faire le lien entre la séquence d'a.a., et la structure de la protéine. les modèles illustrés sont très différents et ils n'ont pas l'expertise de l'enseignant qui sait utiliser le bon modèle au bon moment : le lien entre structure, séquence et fonction d'une protéine Scénario ici
  • Les élèves ont de la difficulté à faire le liens attendus entre des représentions très différentes : la séquence d'a.a., et sa fonction. Comment les aider à savoir prédire / expliquer les effets d'une mutation de la séquence sur le fonctionnement de la protéine ( Mucoviscidose, Anémie falciforme) : Scénario ici
  • Les élèves ont de la peine à utiliser une représentation de la structure d'une protéine pour expliquer/ prédire les interactions de son site actif. P. ex hormone, enzyme, transmembranaire, anticorps, … . Scénario ici
  • CRISPR-Cas-9 : Les interactions complexes entre ARNGuide, ADN, et Cas9 sont difficiles à visualiser à partir de seules images 2D. Manipuler des modèles 3D de la protéine Cas9, l'ADN et l'ARN peut rendre plus concret et aider certains élèves  : Scénario ici
  • Les interactions entre anticorps, antigène sont difficiles à visualiser par les élèves (notamment poche antigénique, épitope,…). Manipuler des modèles 3D de la protéine IgG et de modèles de pathogènes hérissés d'objets magnétiques (petits clous par exemple) peut rendre plus concret ces interactions et aider certains élèves  : Scénario ici
  • Intégrer comment la bivalence des Anticorps  : des antigènes (épitopes plus précisément) représentés par des clous plantés dans des modèles de virus ou bactéries (en sagex ou en bois) peuvent rendre plus concret ces interactions et aider certains élèves  : Scénario ici

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