Trouver la date de divergence évolutive

Trouver la date de divergence évolutive de deux espèces .

la date de divergence ~ date du plus récent ancêtre commun

Procédure 1

• Ouvrir Timetree http://www.timetree.org/
  

  Exemple d'écran de Timetree.org pour la divergence d'Homo sapiens et chimpanzé (Pan troglodytes)
• Choisir ‘node time’ indiquer dans les deux cases les noms (latins) des 2 espèces (ou taxons ?) (Homo sapiens, Pan troglodytes, Mus musculus, Bos taurus, etc).
  • si il y ambiguité le système propose dans "resolve ambiguity" des choix (les cases juste à coté).
• On obtient la date de divergence, (encadré en violet dans l'image) à droite d'un graphique (Climate Change Charts).
  • Ce graphique indique les principaux paramètres géologiques et physiques à travers les époques (Solar Luminosity, Oxygen Levels, Carbon Dioxide Levels, luminosity, Geo Timescale, Earth Impacts, O₂ Levels CO₂ Levels Luminosity)
    • Ces paramètres peuvent être activés ou masqués en cliquant les cases sous "Display".
• On peut alors exporter le graphique

NB : On peut retrouver le nom latin des espèces sur Wikipedia ou sur le site UniProt/ : Chercher le nom commun anglais (pas français). Puis choisir une entrée qui semble être de la bonne espèce : dans la colonne taxonomie, le nom complet apparaît

Procédure 2

• Ouvrir le site OhMyGenes du projet In the light of evolution du SIB
• Choisir "Créer votre propre mème"
• Sélectionner 2 espèces dans la liste ( p.ex. humain et chimpanzé)
• Cliquer le bouton "données scientifiques".
• On obtient les degrés de similitudes A vs B et B vs.A ainsi qu'un temps de divergence :
  • 20038 genes of 20430 (98.1%) from Human shared. 23010 genes of 23534 (97.8%) from Chimpanzee shared.
  • Divergence time between Human and Chimpanzee: 6.7 mya (MYA = Million Years Ago)

Scénarios pédagogiques où il peut s'intégrer

Peut compléter : Preuve de l'évolution par la comparaison de protéines chez différentes espèces

Reférences

Scénario établi à partir d'une demande de B. Birbaum et sur la base des indications scientifiques de M.-C. Blatter du SIB

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