SNP fréquents - changements d'une seule base

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Éprouver que les SNP sont fréquents et sont des changements d'une seule base par exemple dans le gène CFTR

Procédure

Ouvrir Genome data Viewer GDV ici

Préalable trouver une séquence d'un gène : Séquence du gène de protéines sur chromosomes
  • Afficher la séquence d'une protéine à choix : p. ex CFTR
  • [Solution]
Séquence du gène CFTR avec le SNP rs1228922204 sélectionné, mettant en évidence le changement d'une base
Séquence du gène CFTR avec le SNP rs1228922204 sélectionné, mettant en évidence le changement d'une base
    • Si nécessaire zoomer à la séquence (icone ATG),
  • Observer les SNP en bleu (par exemple rs1228922204)
    • -> cliquer sur le SNP choisi
      • repérer la base qui change T<->C dans ce cas

Ce qu'on peut obtenir : p. ex, synthèse par un élève des résultats avec une classe

Scénarios pédagogiques où il peut s'intégrer

Retour à Bioinformatique : opportunités pour l’enseignement

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