Bioinformatique : opportunités pour l’enseignement

Projet ESII Le numérique en biologie (Bioinformatique) : opportunités pour l’enseignement

• Des activités en classe ou de type TP / laboratoire virtuel ou les élèves peuvent vérifier des hypothèses et construire des connaissances en se basant sur les savoirs les plus récents

• Des protocoles-élèves
  • 1) Éprouver que la séquence du gène de quelques protéines est repérable sur les chromosomes humains.
  • 2) Éprouver que la séquence du gène de quelques protéines est bien constituée de ATCG
  • 3) Éprouver qu'une grande partie du génome n'est pas constituée de gènes
  • 4) Éprouver que certains gènes sont constitués d'Introns et d'Exons
  • 5) Éprouver que la limite introns-exons n'est pas discernable aisément
  • 6) Éprouver que les SNP sont fréquents et sont des changements d'une seule base par exemple dans le gène CFTR
  • 7) Savoir choisir les sondes pour déterminer chaque SNP étudié dans une puce à ADN (µ-array)
    • 7b) Éprouver comment on pourrait choisir les sondes pour déterminer un SNP spécifique ( la ∂F508 cause la plus fréquente de la mucoviscidose)  dans une puce à ADN (µ-array)
  • 8) Éprouver que les séquences pour les empreintes (satellites) sont des séquences répétées
  • 9) Comparer pour 3 personnes le nombre de répétitions dans un satellite  sur le chr 1
    • 9b) Variante  Former un schéma du gel pour  une empreinte ADN à partir des séquences sur le chromosome 1 pour 3 personnes
  • 10) Éprouver que l'extrémité des chromosomes humains sont constitués de télomères
  • Déterminer la structure 3D d'une protéine biologiquement importante
  • Convertir la structure de la protéine en fichier pour imprimante 3D(.STL)
• Des exemples de progressions possibles en articulant ces activités
• Des listes de  questions pour guider les activités et les évaluations
• Des fiches techniques pour les manipulations informatiques
• Des Liste de protéines sélectionnées, de structures 3D prêtes à imprimer,
• Une sélection de sites pour les enseignants