Activités Bioinfo dans le chapitre Physiologie
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Physiologie : insertions possibles des activités de biologie numérique
- Les élèves ont de la difficulté à faire le lien entre la séquence d'a.a., et la structure de la protéine. les modèles illustrés sont très différents et ils n'ont pas l'expertise de l'enseignant qui sait utiliser le bon modèle au bon moment : le lien entre structure, séquence et fonction d'une protéine Scénario ici
- Les élèves ont de la difficulté à faire le liens attendus entre des représentions très différentes : la séquence d'a.a., et sa fonction. Comment les aider à savoir prédire / expliquer les effets d'une mutation de la séquence sur le fonctionnement de la protéine ( Mucoviscidose, Anémie falciforme) : Scénario ici
- Les élèves ont de la peine à utiliser une représentation de la structure d'une protéine pour expliquer/ prédire les interactions de son site actif. P. ex hormone, enzyme, transmembranaire, anticorps, … . Scénario ici
- CRISPR-Cas-9 : Les interactions complexes entre ARNGuide, ADN, et Cas9 sont difficiles à visualiser à partir de seules images 2D. Manipuler des modèles 3D de la protéine Cas9, l'ADN et l'ARN peut rendre plus concret et aider certains élèves : Scénario ici
- Les interactions entre anticorps, antigène sont difficiles à visualiser par les élèves (notamment poche antigénique, épitope,…). Manipuler des modèles 3D de la protéine IgG et de modèles de pathogènes hérissés d'objets magnétiques (petits clous par exemple) peut rendre plus concret ces interactions et aider certains élèves : Scénario ici
- Intégrer comment la bivalence des Anticorps : des antigènes (épitopes plus précisément) représentés par des clous plantés dans des modèles de virus ou bactéries (en sagex ou en bois) peuvent rendre plus concret ces interactions et aider certains élèves : Scénario ici