Trouver la date de divergence évolutive
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Trouver la date de divergence évolutive de deux espèces .
la date de divergence ~ date du plus récent ancêtre commun
Procédure 1
- Ouvrir Timetree http://www.timetree.org/
- Choisir ‘node time’ indiquer dans les deux cases les noms (latins) des 2 espèces (ou taxons ?) (Homo sapiens, Pan troglodytes, Mus musculus, Bos taurus, etc).
- si il y ambiguité le système propose dans "resolve ambiguity" (les cases juste à coté) des choix.
- On obtient la date de divergence, à droite (encadré en violet dans l'image) d'un graphique (Climate Change Charts) qui indique les principaux paramètres géologiques à travers les époques (Solar Luminosity, Oxygen Levels, Carbon Dioxide Levels, luminosity, Geo Timescale, Earth Impacts, O2 Levels CO2 Levels Luminosity)
- Ces paramètres peuvent être activés ou masqués en cliquant les cases sous "Display".
- On peut alors exporter le graphique
NB : On peut retrouver le nom latin des espèces sur Wikipedia ou sur le site UniProt/ : Chercher le nom commun anglais (pas français). Puis choisir une entrée qui semble être de la bonne espèce : dans la colonne taxonomie, le nom complet apparaît
Procédure 2
- Ouvrir le site OhMyGenes du projet In the light of evolution
- Choisir "Créer votre propre mème"
- Sélectionner 2 espèces danbs la liste ( p.ex. humain et chimpanzé)
- Cliquer le bouton "données scientifiques".
- On obtient les degrés de similitudes A vs B et B vs.A ainsi qu'un temps de divergence :
- 20038 genes of 20430 (98.1%) from Human shared. 23010 genes of 23534 (97.8%) from Chimpanzee shared.
- Divergence time between Human and Chimpanzee: 6.7 mya (MYA = Million Years Ago)
Scénarios pédagogiques où il peut s'intégrer
Peut compléter : Preuve de l'évolution par la comparaison de protéines chez différentes espèces
Reférences
Scénario établi à partir d'une demande de B. Birbaum et sur la base des indications scientifiques de M.-C. Blatter du SIB