Trouver la date de divergence évolutive

Trouver la date de divergence évolutive de deux espèces .

la date de divergence ~ date du plus récent ancêtre commun

Procédure

• Ouvrir Timetree http://www.timetree.org/
  

  Exemple d'écran de Timetree.org pour la divergence d'Homo sapiens et chimpanzé (Pan troglodytes)
• Choisir ‘node time’ indiquer dans les deux cases les noms (latins) des 2 espèces (ou taxons ?) (Homo sapiens, Pan troglodytes, Mus musculus, Bos taurus, etc).
  • si il y ambiguité le système propose dans "resolve ambiguity" (les cases juste à coté) des choix.
• On obtient la date de divergence, à droite (encadré en violet dans l'image) d'un graphique (Climate Change Charts) qui indique les principaux paramètres géologiques à travers les époques (Solar Luminosity, Oxygen Levels, Carbon Dioxide Levels, luminosity, Geo Timescale, Earth Impacts, O2 Levels CO2 Levels Luminosity)
  • Ces paramètres peuvent être activés ou masqués en cliquant les cases sous "Display".
  • On peut alors exporter le graphique

NB : On peut retrouver le nom latin des espèces sur Wikipedia ou sur le site UniProt/ : Chercher le nom commun anglais (pas français). Puis choisir une entrée qui semble être de la bonne espèce : dans la colonne taxonomie, le nom complet apparaît

Scénarios pédagogiques où il peut s'intégrer

Peut compléter : Preuve de l'évolution par la comparaison de protéines chez différentes espèces

Reférences

Scénario établi à partir d'une demande de B. Birbaum et sur la base des indications scientifiques de M.-C. Blatter du SIB

Retour à Bioinformatique : opportunités pour l’enseignement