« SNP fréquents - changements d'une seule base » : différence entre les versions
Aller à la navigation
Aller à la recherche
mAucun résumé des modifications |
m (mise en page mineure) |
||
| Ligne 9 : | Ligne 9 : | ||
* [[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/gdv/browser/?context=genome&acc=GCF_000001405.39 Solution]] | * [[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/gdv/browser/?context=genome&acc=GCF_000001405.39 Solution]] | ||
[[Fichier:SNP-rs1545397-OCA2-in-GDV.jpg|alt=Séquence du gène CFTR avec le SNP rs1228922204 sélectionné, mettant en évidence le changement d'une base |vignette|Séquence du gène CFTR avec le SNP rs1228922204 sélectionné, mettant en évidence le changement d'une base]] | [[Fichier:SNP-rs1545397-OCA2-in-GDV.jpg|alt=Séquence du gène CFTR avec le SNP rs1228922204 sélectionné, mettant en évidence le changement d'une base |vignette|Séquence du gène CFTR avec le SNP rs1228922204 sélectionné, mettant en évidence le changement d'une base]] | ||
* Si nécessaire zoomer à la séquence (icone <small>A</small><big>T</big><small>G</small>), | |||
* Observer les SNP en bleu (par exemple rs1228922204) | * Observer les SNP en bleu noter leur fréquence | ||
* En choisir un (par exemple rs1228922204) | |||
* | * -> cliquer sur le SNP choisi [[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/gdv/browser/genome/?cfg=NCID_1_2672790_130.14.18.128_9146_1584719593_4194249537 solution]] | ||
* Repérer la base qui change T<->C dans ce cas | |||
== ''Ce qu'on peut obtenir : p. ex, synthèse par un élève des résultats avec une classe '' == | == ''Ce qu'on peut obtenir : p. ex, synthèse par un élève des résultats avec une classe '' == | ||
Version du 20 mars 2020 à 17:56
Éprouver que les SNP sont fréquents et sont des changements d'une seule base par exemple dans le gène CFTR
Procédure
Ouvrir Genome data Viewer GDV ici
Préalable trouver une séquence d'un gène : Séquence du gène de protéines sur chromosomes
- Afficher la séquence d'une protéine à choix : p. ex CFTR
- [Solution]
- Si nécessaire zoomer à la séquence (icone ATG),
- Observer les SNP en bleu noter leur fréquence
- En choisir un (par exemple rs1228922204)
- -> cliquer sur le SNP choisi [solution]
- Repérer la base qui change T<->C dans ce cas