« Gènes constitués d'Introns et d'Exons » : différence entre les versions
Aller à la navigation
Aller à la recherche
m (introduction d'une image mise au point du texte) |
m (commentaire élèves) |
||
| Ligne 2 : | Ligne 2 : | ||
== Procédure == | == Procédure == | ||
Ouvrir Genome data Viewer GDV [https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/gdv/ ici] | * Ouvrir Genome data Viewer GDV [https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/gdv/ ici] | ||
[[Fichier:CFTR gene Exon7 highlith in GDV.jpg|alt=CFTR gene Exon7 highlith in GDV|vignette|CFTR gene Exon7 highlith in GDV]] | [[Fichier:CFTR gene Exon7 highlith in GDV.jpg|alt=CFTR gene Exon7 highlith in GDV|vignette|CFTR gene Exon7 highlith in GDV]] | ||
Sélectionner un gène (p. ex CFTR) selon protocole | * Sélectionner un gène (p. ex CFTR) selon protocole ([https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/gdv/browser/blast/?cfg=NCID_1_32903492_130.14.18.128_9146_1584116293_2168709450 solution]) | ||
* Cliquer les petits ronds dans la bande bleue pour mettre en évidence un exon à la fois . | |||
Cliquer les petits ronds dans la bande bleue pour mettre en évidence un exon. | * Observer la séquence d'ADN correspondante et le sens de lecture ( flèches dans la bande verte) | ||
* Observer les bandes bleues plus bas sous RNAseq exon coverage et RNAseq intron spanning read | |||
Observer la séquence d'ADN correspondante et le sens de lecture ( flèches dans la bande verte) | * Recmmencer avec 3-4 exons | ||
Observer les bandes bleues plus bas sous RNAseq exon coverage et RNAseq intron spanning read | |||
== Ce qu'on peut obtenir : p. ex, synthèse par un élève des résultats avec une classe == | == Ce qu'on peut obtenir : p. ex, synthèse par un élève des résultats avec une classe == | ||
Synthèse d'un élève : En zoomant sur le gène en question ( cela fonctionne pour tous les gènes étudiés dans la classe, on remarque la présence d’introns et d’exons à l’aide des blocs et lignes colorées en verts ( ou différentes couleurs ). Les exons, plus petits que les introns sont aussi moins exprimés que ces introns. La présence d’introns prouve l’utilisation de l’épissage alternatif de la part du gène. | |||
== Scénarios pédagogiques où il peut s'intégrer == | == Scénarios pédagogiques où il peut s'intégrer == | ||
Version du 13 mars 2020 à 17:21
Éprouver que certains gènes sont constitués d'Introns et d'Exons
Procédure
- Ouvrir Genome data Viewer GDV ici
- Sélectionner un gène (p. ex CFTR) selon protocole (solution)
- Cliquer les petits ronds dans la bande bleue pour mettre en évidence un exon à la fois .
- Observer la séquence d'ADN correspondante et le sens de lecture ( flèches dans la bande verte)
- Observer les bandes bleues plus bas sous RNAseq exon coverage et RNAseq intron spanning read
- Recmmencer avec 3-4 exons
Ce qu'on peut obtenir : p. ex, synthèse par un élève des résultats avec une classe
Synthèse d'un élève : En zoomant sur le gène en question ( cela fonctionne pour tous les gènes étudiés dans la classe, on remarque la présence d’introns et d’exons à l’aide des blocs et lignes colorées en verts ( ou différentes couleurs ). Les exons, plus petits que les introns sont aussi moins exprimés que ces introns. La présence d’introns prouve l’utilisation de l’épissage alternatif de la part du gène.