« Gènes constitués d'Introns et d'Exons » : différence entre les versions

De EduTech Wiki
Aller à la navigation Aller à la recherche
(bases du protocole)
 
m (introduction d'une image mise au point du texte)
Ligne 3 : Ligne 3 :
== Procédure ==
== Procédure ==
Ouvrir Genome data Viewer GDV [https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/gdv/ ici]
Ouvrir Genome data Viewer GDV [https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/gdv/ ici]
 
[[Fichier:CFTR gene Exon7 highlith in GDV.jpg|alt=CFTR  gene Exon7 highlith in GDV|vignette|CFTR  gene Exon7 highlith in GDV]]
Sélectionner un gène (p. ex CFTR) selon protocole  
Sélectionner un gène (p. ex CFTR) selon protocole  


https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/gdv/browser/?context=blast&id=NC_000005.10
Cliquer les petits ronds dans la bande bleue pour mettre en évidence un exon.  


Cliquer les petits ronds dans la bande bleue pour mettre en évidence un exon.
Observer la séquence d'ADN correspondante et le sens de lecture ( flèches dans la bande verte) 


Observer les bandes bleues plus bas sous RNAseq exon coverage et RNAseq intron spanning read 


Puis un autre


== Ce qu'on peut obtenir :  p. ex,  synthèse par un élève des résultats avec une classe  ==
== Ce qu'on peut obtenir :  p. ex,  synthèse par un élève des résultats avec une classe  ==

Version du 13 mars 2020 à 17:17

Éprouver que certains gènes sont constitués d'Introns et d'Exons

Procédure

Ouvrir Genome data Viewer GDV ici

CFTR gene Exon7 highlith in GDV
CFTR gene Exon7 highlith in GDV

Sélectionner un gène (p. ex CFTR) selon protocole

Cliquer les petits ronds dans la bande bleue pour mettre en évidence un exon.

Observer la séquence d'ADN correspondante et le sens de lecture ( flèches dans la bande verte)

Observer les bandes bleues plus bas sous RNAseq exon coverage et RNAseq intron spanning read

Puis un autre

Ce qu'on peut obtenir : p. ex, synthèse par un élève des résultats avec une classe

Scénarios pédagogiques où il peut s'intégrer

Retour à Bioinformatique : opportunités pour l’enseignement