« Les séquences pour les empreintes (satellites) sont des séquences répétées » : différence entre les versions
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Situer l'espèce (p. ex. humaine) dans l'arborescence, puis la choisir. | |||
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Un exemple de satellite est sur le chromosome 5 (dès la position [https://www.ncbi.nlm.nih.gov/projects/sviewer/?id=NC_000005.10&tracks=[key:sequence_track,name:Sequence,display_name:Sequence,id:T15993,subkey:sequence,dbname:GenBank,annots:NA,ShowLabel:false,ColorGaps:false,shown:true,order:1][key:graph_track,name:RNA-s 177 326 740 à 177 326 980] environ): voici [https://go.usa.gov/xvFeE la séquence] dans laquelle on trouve des répétitions de la séquence AAAGAAAG | |||
Observer qu'il n'y a pas d'exons ( -> ~ non codant) cf [[Gènes constitués d'Introns et d'Exons|Éprouver que certains gènes sont constitués d'Introns et d'Exons]] | |||
Observer le nombre de répétitions, en cliquant les flèches à droite ou à gauche dans la barre grise en dessus de la séquence (pan left et pan right) | |||
Observer la fin et le début en cliquant ces flèches jusqu'à la fin des répétitions | |||
[[Comparer pour 3 personnes le nombre de répétitions dans un satellite sur le chr 1]] | |||
== ''Ce qu'on peut obtenir : p. ex, synthèse par un élève des résultats avec une classe '' == | == ''Ce qu'on peut obtenir : p. ex, synthèse par un élève des résultats avec une classe '' == | ||
== Scénarios pédagogiques où il peut s'intégrer == | == Scénarios pédagogiques où il peut s'intégrer == | ||
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===== Références ===== | |||
Scénario établi en partie sur la base des indications scientifiques de M.-C. Blatter du SIB | |||
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Dernière version du 1 octobre 2021 à 16:40
Éprouver que les séquences pour les empreintes (satellites) sont des séquences répétées
Procédure
Ouvrir Genome data Viewer GDV ici Situer l'espèce (p. ex. humaine) dans l'arborescence, puis la choisir.
Un exemple de satellite est sur le chromosome 5 (dès la position 177 326 740 à 177 326 980 environ): voici la séquence dans laquelle on trouve des répétitions de la séquence AAAGAAAG
Observer qu'il n'y a pas d'exons ( -> ~ non codant) cf Éprouver que certains gènes sont constitués d'Introns et d'Exons
Observer le nombre de répétitions, en cliquant les flèches à droite ou à gauche dans la barre grise en dessus de la séquence (pan left et pan right)
Observer la fin et le début en cliquant ces flèches jusqu'à la fin des répétitions
Comparer pour 3 personnes le nombre de répétitions dans un satellite sur le chr 1
Ce qu'on peut obtenir : p. ex, synthèse par un élève des résultats avec une classe
Scénarios pédagogiques où il peut s'intégrer
Références
Scénario établi en partie sur la base des indications scientifiques de M.-C. Blatter du SIB