« Activités Bioinfo dans le chapitre Physiologie » : différence entre les versions
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== Physiologie : insertions possibles des activités de biologie numérique == | == Physiologie : insertions possibles des activités de biologie numérique == | ||
* | * Les élèves ont de la difficulté à faire le lien entre la séquence d'a.a., et la structure de la protéine. Les modèles illustrés sont très différents et ils n'ont pas l'expertise de l'enseignant qui sait utiliser le bon modèle au bon moment : le lien entre structure, séquence et fonction d'une protéine [[Éprouver le lien entre structure, séquence et fonction d'une protéine|Scénario ici]] | ||
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* | **Hémoglobine [[Fichier:Hemoglobine-3D-2hhb.jpg|vignette|60x60px]]quand on étudie la respiration, les rôles de la circulation, les échanges gazeux, … | ||
**ATPase [[Fichier:ATP synthase 3D printed.jpg|vignette|83x83px]]quand on étudie la respiration cellulaire | |||
**Le récepteur au neurotransmetteur Acetylcholine [[Fichier:2bg9 acétycholine-Receptor.jpg|vignette|104x104px]]quand on étudie la synapse, | |||
*** par analogie avec d'autres récepteurs lorsqu'on étudie les drogues | |||
*** par analogie avec les canaux ioniques dans l'influx nerveux, etc. | |||
* Les élèves ont de la difficulté à faire le liens attendus entre des représentions très différentes : la séquence d'a.a., et sa fonction. Comment les aider à savoir prédire / expliquer les effets d'une mutation de la séquence sur le fonctionnement de la protéine (Mucoviscidose, Anémie falciforme) : [[Éprouver le lien entre structure, séquence et fonction d'une protéine|Scénario ici]] | |||
* Les élèves ont de la peine à utiliser une représentation de la structure d'une protéine pour expliquer/ prédire les interactions de son site actif. P. ex hormone, enzyme, transmembranaire, anticorps, … . [[Déterminer la structure 3D d'une protéine biologiquement importante|Scénario ici]] | |||
*[[Fichier:Cas9-5F9R-crispr-model 3D.jpg|vignette|60x60px]]CRISPR-Cas-9 : Les interactions complexes entre ARNGuide, ADN, et Cas9 sont difficiles à visualiser à partir de seules images 2D. Manipuler des modèles 3D de la protéine Cas9, l'ADN et l'ARN peut rendre plus concret et aider certains élèves : [[Prédire la répartition des espèces à partir de mesures et des valeurs écologiques ?|Scénario ici]] | |||
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Dernière version du 23 mars 2021 à 15:20
Physiologie : insertions possibles des activités de biologie numérique
- Les élèves ont de la difficulté à faire le lien entre la séquence d'a.a., et la structure de la protéine. Les modèles illustrés sont très différents et ils n'ont pas l'expertise de l'enseignant qui sait utiliser le bon modèle au bon moment : le lien entre structure, séquence et fonction d'une protéine Scénario ici
- Exemples :
- Hémoglobine quand on étudie la respiration, les rôles de la circulation, les échanges gazeux, …
- ATPase quand on étudie la respiration cellulaire
- Le récepteur au neurotransmetteur Acetylcholine quand on étudie la synapse,
- par analogie avec d'autres récepteurs lorsqu'on étudie les drogues
- par analogie avec les canaux ioniques dans l'influx nerveux, etc.
- Les élèves ont de la difficulté à faire le liens attendus entre des représentions très différentes : la séquence d'a.a., et sa fonction. Comment les aider à savoir prédire / expliquer les effets d'une mutation de la séquence sur le fonctionnement de la protéine (Mucoviscidose, Anémie falciforme) : Scénario ici
- Les élèves ont de la peine à utiliser une représentation de la structure d'une protéine pour expliquer/ prédire les interactions de son site actif. P. ex hormone, enzyme, transmembranaire, anticorps, … . Scénario ici
- CRISPR-Cas-9 : Les interactions complexes entre ARNGuide, ADN, et Cas9 sont difficiles à visualiser à partir de seules images 2D. Manipuler des modèles 3D de la protéine Cas9, l'ADN et l'ARN peut rendre plus concret et aider certains élèves : Scénario ici
