« Déterminer les organes exprimant un gène donné » : différence entre les versions
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* Ouvrir The Human Protein Atlas [https://www.proteinatlas.org/ solution] | * Ouvrir The Human Protein Atlas [https://www.proteinatlas.org/ solution] | ||
* Choisir Tissue [https://www.proteinatlas.org/humanproteome/tissue -> solution] | * Choisir Tissue [https://www.proteinatlas.org/humanproteome/tissue -> solution] | ||
* Introduire le nom du gène dont on veut connaître l'expression dans le champ "Search" en haut. P. ex [https://www.proteinatlas.org/search/ACE2 ACE2 -> solution][[Fichier:ACE2-expression-schema-from-proteinatlas.jpg|alt=Schéma de l'expression de la protéine ACE2-expression dans proteinatlas|vignette|Schéma de l'expression de la protéine ACE2-expression dans | * Introduire le nom du gène dont on veut connaître l'expression dans le champ "Search" en haut. P. ex [https://www.proteinatlas.org/search/ACE2 ACE2 -> solution][[Fichier:ACE2-expression-schema-from-proteinatlas.jpg|alt=Schéma de l'expression de la protéine ACE2-expression dans proteinatlas|vignette|Schéma de l'expression de la protéine ACE2-expression dans ProteinAtlas]] | ||
* Choisir dans la ligne "Angiotensin I converting enzyme 2" la vignette "[https://www.proteinatlas.org/ENSG00000130234-ACE2/tissue tissue" -> solution] | * Choisir dans la ligne "Angiotensin I converting enzyme 2" la vignette "[https://www.proteinatlas.org/ENSG00000130234-ACE2/tissue tissue" -> solution] | ||
* Un schéma du corps humain féminin et masculin affiche en rose et rouge les régions ou s'exprime le gène sélectionné (ACE2 dans ce cas) [http://1.bp.blogspot.com/-_xj64ijTtLU/X4QHNYcBiKI/AAAAAAAAMJs/7fVq907buicXxTWE-dFRq9SGVDzVIBu-gCK4BGAYYCw/s320/ACE2-expression-proteinatlas-714136.jpg] | * Un schéma du corps humain féminin et masculin affiche en rose et rouge les régions ou s'exprime le gène sélectionné (ACE2 dans ce cas) [http://1.bp.blogspot.com/-_xj64ijTtLU/X4QHNYcBiKI/AAAAAAAAMJs/7fVq907buicXxTWE-dFRq9SGVDzVIBu-gCK4BGAYYCw/s320/ACE2-expression-proteinatlas-714136.jpg] | ||
Version du 27 septembre 2022 à 13:31
Localisation de l'expression d'un gène dans l'organisme
Procédure
- Ouvrir The Human Protein Atlas solution
- Choisir Tissue -> solution
- Introduire le nom du gène dont on veut connaître l'expression dans le champ "Search" en haut. P. ex ACE2 -> solution
- Choisir dans la ligne "Angiotensin I converting enzyme 2" la vignette "tissue" -> solution
- Un schéma du corps humain féminin et masculin affiche en rose et rouge les régions ou s'exprime le gène sélectionné (ACE2 dans ce cas) [1]
![[1]](http://1.bp.blogspot.com/-_xj64ijTtLU/X4QHNYcBiKI/AAAAAAAAMJs/7fVq907buicXxTWE-dFRq9SGVDzVIBu-gCK4BGAYYCw/s320/ACE2-expression-proteinatlas-714136.jpg){kind=link}
- Plus bas dans la page les organes sont listés et des barres d’histogramme indiquent le degré d'expression du gène (en protéine d'abord,…)
NB: On voit que ACE2 sur laquelle se fixe Spike du virus SARS-Cov2 est présente à de nombreux endroits du corps et pas seulement dans les voies respiratoires - probablement parce que c'est par là que le virus entre le plus souvent. Mais le site ne visualise pas beaucoup d'expression de ACE2 a ces endroits. La liste n'est pas exhaustive et dépend des données existantes. Par ailleurs ces images peuvent bien expliquer la diversité des organes aussi attaqués par ce virus.
Autres liens
- Activité proposée par le SIB mettant en évidence le rôle de la protéine Spike et la manière dont elle interagit avec ACE2: "La protéine Spike de SARS-CoV-2"
Scénarios pédagogiques où il peut s'intégrer
Références
Scénario établi en partie sur la base des indications scientifiques de M.-C. Blatter du SIB