Bioinformatique : opportunités pour l’enseignement

Projet ESII Le numérique en biologie (Bioinformatique) : opportunités pour l’enseignement

• Des activités en classe ou de type TP / laboratoire virtuel ou les élèves peuvent vérifier des hypothèses et construire des connaissances en se basant sur les savoirs les plus récents

1) Éprouver que la séquence du gène de quelques protéines est repérable sur les chromosomes humains.

(Propositions EPO, INS, AMY1A, HIST1H4A, CFTR, GH1, MC1R, TP53, ATP5F1A, AVPR1A, COL1A1, CYTB, OPN1LW, RHO , GULOP(pseudogène) )

Ouvrir Genome data Viewer GDV ici

Choisir l'espèce humaine, taper CFTR, le gène est affiché

cf les résultats d'une classe synthèse par un élève

La séquence du gène de quelques protéines est repérable sur les chromosomes humains, on a pu le confirmer grâce à Genome Data Viewer :

• Pour l’EPO : il se trouve sur le chromosome 7, sur le bras long et approximativement au milieu de celui-ci.
• Pour l’INS : il se situe sur le chromosome 11, à l’extrémité distale du brin court, dans la région 105.
• Pour l’AMY1A : on retrouve le gène AMY1A sur le chromosome 1.
• Pour l’HIST1H4A : il est repérable sur le chromosome 6,. sur le bras court.
• Pour CFTR : on le retrouve sur le chromosome 7 chez l’homme ( et sur le chromosome 6 chez la souris )
• Pour GH1 : Ce gène se situe sur le chromosome 17, sur le long brin à l’extrémité.
• Pour MC1R : Il se trouve sur le chromosome 16, à l’extrémité droite du gène.
• Pour GULOP ( pseudogène) : ce pseudogène est repérable sur le chromosome 8, sur le bras court.

• Des protocoles-élèves
• Des exemples de progressions possibles en articulant ces activités
• Des listes de  questions pour guider les activités et les évaluations
• Des fiches techniques pour les manipulations informatiques
• Des Liste de protéines sélectionnées, de structures 3D prêtes à imprimer,
• Une sélection de sites pour les enseignants