Déterminer les organes exprimant un gène donné

Procédure

• Ouvrir The Human Protein Atlas solution
• Choisir Tissue -> solution
• Introduire le nom du gène dont on veut connaître l'expression dans le champ "Search" en haut. P. ex ACE2 -> solution
  

  Schéma de l'expression de la protéine ACE2-expression dans ProteinAtlas
• Choisir dans la ligne "Angiotensin I converting enzyme 2" la vignette "tissue" -> solution
• Un schéma du corps humain féminin et masculin affiche en rose et rouge les régions ou s'exprime le gène sélectionné (ACE2 dans ce cas) [1]

• Plus bas dans la page les organes sont listés et des barres d’histogramme indiquent le degré d'expression du gène (en protéine d'abord,…)

NB: On voit que ACE2 sur laquelle se fixe Spike du virus SARS-Cov2 est présente à de nombreux endroits du corps et pas seulement dans les voies respiratoires. On l'imaginerait surtout là parce que c'est par là que le virus entre le plus souvent. Mais le site ne visualise pas beaucoup d'expression de ACE2 à ces endroits. On a trouvé que le virus s'attaque à de nombreux autres organes s'il n'est pas éliminé près de son entrée. Ainsi ces images peuvent bien expliquer la diversité des organes aussi attaqués par ce virus.

Autres liens

• Activité proposée par le SIB mettant en évidence le rôle de la protéine Spike et la manière dont elle interagit avec ACE2: "La protéine Spike de SARS-CoV-2"

Scénarios pédagogiques où il peut s'intégrer

Références

Scénario établi en partie sur la base des indications scientifiques de M.-C. Blatter du SIB

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