« L'extrémité des chromosomes constitués de télomères » : différence entre les versions

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== Procédure ==
== Procédure ==
Ouvrir Genome data Viewer GDV [https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/gdv/ ici]


Choisir une protéine  pour afficher un chromosome (ici le 17 avec l'insuline gène INS)
* Ouvrir Genome data Viewer GDV [https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/gdv/ ici]
 
* Choisir un gène pour afficher un chromosome (ici le 17 avec le gène TP53) [https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/gdv/browser/genome/?id=GCF_000001405.39 Solution]
Décaler le cadre visible à une extrémité en sélectionnant une zone dans le schéma du chromosome ou cliquer dans la barre qui visibilise la séquence et choisir le menu local, Cliquer zoom to sequence, ajuster en cliquant les flèches droire ou gauche.
* Décaler le cadre visible à une extrémité en sélectionnant une zone dans le schéma du chromosome ou cliquer dans la barre qui visibilise la séquence
 
[[Fichier:Zoom-to-telomere-chr7-inGDV.jpg|alt=Menu Local pour zoomer sur la séquence dans GDV- exemple Chr17|vignette|Menu Local pour zoomer sur la séquence dans GDV- exemple Chr17]]
On voit que la séquence du télomère est indiquée comme NNNNNN…  parce qu'il est impossible (ou très difficile) de séquencer une zone massivement répétée (ce devrait être des répétition tandem  TTAGGG).
 
Ce lien devrait vous y conduire directement :
 
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/gdv/browser/genome/?id=GCF_000001405.39


* Choisir le menu local.


* Cliquer zoom to sequence, ajuster en cliquant les flèches droite ou gauche.
** Ce lien vous y conduit directement : [https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/gdv/browser/genome/?cfg=NCID_1_32756966_130.14.18.128_9146_1664281324_38149652 Solution] <small>Sera valable 90 jours depuis le 25.09.22</small>
* On voit que la séquence du télomère est indiquée comme NNNNNN…  parce qu'il est impossible (ou très difficile) de séquencer une zone massivement répétée (ce devrait être des répétition tandem  TTAGGG).
[[Fichier:Telomere-NNNNN-chr7-inGDV.jpg|alt=Telomère affichant des NNNNN- exemple -chr 17-in GDV|vignette|Telomere- affichant des NNNNN- exemple -chr17 in GDV]]


== ''Ce qu'on peut obtenir :  p. ex,  synthèse par un élève des résultats avec une classe ''  ==
== ''Ce qu'on peut obtenir :  p. ex,  synthèse par un élève des résultats avec une classe ''  ==
''N'hésitez pas à proposer les vôtres''


== Scénarios pédagogiques où il peut s'intégrer ==
== Scénarios pédagogiques où il peut s'intégrer ==
*
===== Références =====
Scénario établi en partie sur la base des indications scientifiques de M.-C. Blatter du SIB


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[[Catégorie: BioInfoScenarios]]
[[Catégorie: BioInfoScenarios]]

Dernière version du 27 septembre 2022 à 13:25

Éprouver que l'extrémité des chromosomes humains sont constitués de télomères

Procédure

  • Ouvrir Genome data Viewer GDV ici
  • Choisir un gène pour afficher un chromosome (ici le 17 avec le gène TP53) Solution
  • Décaler le cadre visible à une extrémité en sélectionnant une zone dans le schéma du chromosome ou cliquer dans la barre qui visibilise la séquence
Menu Local pour zoomer sur la séquence dans GDV- exemple Chr17
Menu Local pour zoomer sur la séquence dans GDV- exemple Chr17
  • Choisir le menu local.
  • Cliquer zoom to sequence, ajuster en cliquant les flèches droite ou gauche.
    • Ce lien vous y conduit directement : Solution Sera valable 90 jours depuis le 25.09.22
  • On voit que la séquence du télomère est indiquée comme NNNNNN… parce qu'il est impossible (ou très difficile) de séquencer une zone massivement répétée (ce devrait être des répétition tandem TTAGGG).
Telomère affichant des NNNNN- exemple -chr 17-in GDV
Telomere- affichant des NNNNN- exemple -chr17 in GDV

Ce qu'on peut obtenir : p. ex, synthèse par un élève des résultats avec une classe

N'hésitez pas à proposer les vôtres

Scénarios pédagogiques où il peut s'intégrer

Références

Scénario établi en partie sur la base des indications scientifiques de M.-C. Blatter du SIB

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