« Génome pas constitué de gènes seulement » : différence entre les versions
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Choisir l'espèce humaine, taper CFTR | Choisir l'espèce humaine, taper CFTR <small>( ou un autre exemple EPO, INS, AMY1A, HIST1H4A, CFTR, GH1, MC1R, TP53, ATP5F1A, AVPR1A, COL1A1, CYTB, OPN1LW, RHO , GULOP (pseudogène). )</small> | ||
Dézoomer (loupe - ou zoomer loupe +) pour avoir une vue d’ensemble d' un | Dézoomer (loupe - ) ou zoomer (loupe +) pour avoir une vue d’ensemble d' un large part du chromosome étudié - on voit la zone en grisé bleu s'élargir, aller jusqu'à au moins un dixième, mais en visualisant la totalité c'est encore plus visible. | ||
Observer les gènes (indiqués par des barres) et les zones qui ne sont pas des gènes . | Observer les gènes (indiqués par des barres) et les zones qui ne sont pas des gènes. | ||
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Ces zones d'ATCG sont-elles codantes au sens vu en classe ? | |||
Trouver d'autres gènes connus | |||
P. ex si on est parti de INS (Chr11: 2,159,779 - 2,161,209 ) on peut trouver HBB (hemoglobin subunit beta) : dézoomer et à droite trouver la région 5,200 k zoomer sur la position (Chr11: 5,225,464 - 5,227,071) [https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/gdv/browser/genome/?cfg=NCID_1_26088728_130.14.18.128_9146_1663924700_672495646 solution] <small>(en date du 23.09.22)</small> | |||
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Scénario établi en partie sur la base des indications scientifiques de M.-C. Blatter du SIB | |||
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Dernière version du 23 septembre 2022 à 10:20
Éprouver qu'une grande partie du génome n'est pas constituée de gènes
Procédure
Ouvrir Genome data Viewer GDV ici
Suivre ce scénario
Choisir l'espèce humaine, taper CFTR ( ou un autre exemple EPO, INS, AMY1A, HIST1H4A, CFTR, GH1, MC1R, TP53, ATP5F1A, AVPR1A, COL1A1, CYTB, OPN1LW, RHO , GULOP (pseudogène). )
Dézoomer (loupe - ) ou zoomer (loupe +) pour avoir une vue d’ensemble d' un large part du chromosome étudié - on voit la zone en grisé bleu s'élargir, aller jusqu'à au moins un dixième, mais en visualisant la totalité c'est encore plus visible.
Observer les gènes (indiqués par des barres) et les zones qui ne sont pas des gènes.
Estimer la proportion de l'ADN qui est des gènes
Ces zones d'ATCG sont-elles codantes au sens vu en classe ?
Trouver d'autres gènes connus
P. ex si on est parti de INS (Chr11: 2,159,779 - 2,161,209 ) on peut trouver HBB (hemoglobin subunit beta) : dézoomer et à droite trouver la région 5,200 k zoomer sur la position (Chr11: 5,225,464 - 5,227,071) solution (en date du 23.09.22)
Ce qu'on peut obtenir : p. ex, synthèse par un élève des résultats avec une classe
Lorsqu’on dézoome pour avoir une vue d’ensemble du chromosome où le gène se situe ( en général, pour tous les gènes étudiés par la classe, on remarque que les gènes ne constituent qu’une infime partie du génome). Entre les gènes, on retrouve des séquences non codantes. Il existe donc des bases ATCG qui ne codent pas.
Scénarios pédagogiques où il peut s'intégrer
Références
Scénario établi en partie sur la base des indications scientifiques de M.-C. Blatter du SIB