Voir la source de SNP fréquents - changements d'une seule base

== Éprouver que les SNP sont fréquents et sont des changements d'une seule base par exemple dans le gène CFTR ==

== Procédure ==
Ouvrir Genome data Viewer GDV [https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/gdv/ ici]

====== Préalable trouver une séquence d'un gène : [[Séquence du gène de protéines sur chromosomes]] ======

* Afficher la séquence d'une protéine à choix : p. ex CFTR [[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/gdv/browser/genome/?id=GCF_000001405.40 Solution]]
[[Fichier:SNP-rs1545397-OCA2-in-GDV.jpg|alt=Séquence du gène CFTR avec le SNP rs1228922204 sélectionné, mettant en évidence le changement d'une base|vignette]]
* Si nécessaire zoomer à la séquence (icone <small>A</small><big>T</big><small>G</small>),

* Observer les SNP en bleu noter leur fréquence 
* En choisir un  (par exemple rs1228922204)
* -> cliquer sur le SNP choisi, 
* ou le chercher en introduisant son identifiant dans la case search assembly en haut à gauche [[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/snp/rs947311024 solution]] <small>valable 90 jours depuis le 25.09.22</small>
* Repérer la base qui change A<->G dans ce cas

== ''Ce qu'on peut obtenir :  p. ex,  synthèse par un élève des résultats avec une classe ''  ==
''Ajoutez votre exemple'' 

== Scénarios pédagogiques où il peut s'intégrer ==
Afin d'aider les élèves à imaginer ce qu'est un SNP, pourrait précéder : 

* [[Choisir les sondes pour tester SNP sur micro-array|Savoir choisir les sondes pour déterminer chaque SNP étudié dans une puce à ADN (µ-array)]]

===== Références =====
Scénario établi en partie sur la base des indications scientifiques de M.-C. Blatter du SIB

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[[Catégorie: BioInfoScenarios]]