« Séquence du gène de protéines sur chromosomes » : différence entre les versions

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Proposition d'exemples  EPO, INS, AMY1A, HIST1H4A, CFTR, GH1, MC1R, TP53,  ATP5F1A, AVPR1A, COL1A1, CYTB, OPN1LW, RHO , GULOP(pseudogène).
Proposition d'exemples  EPO, INS, AMY1A, HIST1H4A, CFTR, GH1, MC1R, TP53,  ATP5F1A, AVPR1A, COL1A1, CYTB, OPN1LW, RHO , GULOP(pseudogène).


===== Procédure =====
Ouvrir Genome data Viewer GDV [https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/gdv/ ici]
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Choisir l'espèce humaine dans l'arborescence,  
Choisir l'espèce humaine dans l'arborescence,  
* taper le nom du gène ( p. ex. CFTR),  
[[Fichier:GdV-HS-parmi-sp.jpg|vignette|108x108px]]
* le gène s'affiche (bande verte avec le nom du gène au-dessus), le chromosome correspondant est encadré dans l'encadré à gauche.   
* Taper le nom du gène ( p. ex. CFTR),  
* On peut le situer sur le chromosome en examinant le schéma du chromosome en haut et le repère de la zone agrandie : en bleu assez fin.  
* Le gène s'affiche (bande verte avec le nom du gène au-dessus), le chromosome correspondant est encadré dans l'encadré à gauche.   
''Ce qu'on peut obtenir ex  les résultats d'une classe : synthèse par un élève''
* On peut le situer sur le chromosome en examinant le schéma du chromosome en haut et le repère de la zone agrandie : trait vertical bleu assez fin[[Fichier:GDV-CFTR-seq.jpg|vignette]]


===== ''Ce qu'on peut obtenir ex  les résultats d'une classe : synthèse par un élève'' =====
''La séquence du gène de quelques protéines est repérable sur les chromosomes humains, on a pu le confirmer grâce à Genome Data Viewer :''
''La séquence du gène de quelques protéines est repérable sur les chromosomes humains, on a pu le confirmer grâce à Genome Data Viewer :''
* ''Pour l’EPO : il se trouve sur le chromosome 7, sur le bras long et approximativement au milieu de celui-ci.''
* ''Pour l’EPO : il se trouve sur le chromosome 7, sur le bras long et approximativement au milieu de celui-ci.''
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* ''Pour MC1R : Il se trouve sur le  chromosome 16, à l’extrémité droite du gène.''
* ''Pour MC1R : Il se trouve sur le  chromosome 16, à l’extrémité droite du gène.''
* ''Pour GULOP ( pseudogène) : ce pseudogène est repérable sur le chromosome 8, sur le bras court.''
* ''Pour GULOP ( pseudogène) : ce pseudogène est repérable sur le chromosome 8, sur le bras court.''
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[[Catégorie: BioInfoScenarios]]
[[Catégorie: BioInfoScenarios]]

Version du 4 mars 2020 à 17:33

1) Éprouver que la séquence du gène de quelques protéines est repérable sur les chromosomes humains.

Proposition d'exemples EPO, INS, AMY1A, HIST1H4A, CFTR, GH1, MC1R, TP53, ATP5F1A, AVPR1A, COL1A1, CYTB, OPN1LW, RHO , GULOP(pseudogène).

Procédure

Ouvrir Genome data Viewer GDV ici

Choisir l'espèce humaine dans l'arborescence,

GdV-HS-parmi-sp.jpg
  • Taper le nom du gène ( p. ex. CFTR),
  • Le gène s'affiche (bande verte avec le nom du gène au-dessus), le chromosome correspondant est encadré dans l'encadré à gauche.
  • On peut le situer sur le chromosome en examinant le schéma du chromosome en haut et le repère de la zone agrandie : trait vertical bleu assez fin
    GDV-CFTR-seq.jpg
Ce qu'on peut obtenir ex les résultats d'une classe : synthèse par un élève

La séquence du gène de quelques protéines est repérable sur les chromosomes humains, on a pu le confirmer grâce à Genome Data Viewer :

  • Pour l’EPO : il se trouve sur le chromosome 7, sur le bras long et approximativement au milieu de celui-ci.
  • Pour l’INS : il se situe sur le chromosome 11, à l’extrémité distale du brin court, dans la région 105.
  • Pour l’AMY1A : on retrouve le gène AMY1A sur le chromosome 1.
  • Pour l’HIST1H4A : il est repérable sur le chromosome 6,. sur le bras court.
  • Pour CFTR : on le retrouve sur le chromosome 7 chez l’homme ( et sur le chromosome 6 chez la souris )
  • Pour GH1 : Ce gène se situe sur le chromosome 17, sur le long brin à l’extrémité.
  • Pour MC1R : Il se trouve sur le chromosome 16, à l’extrémité droite du gène.
  • Pour GULOP ( pseudogène) : ce pseudogène est repérable sur le chromosome 8, sur le bras court.