« L'extrémité des chromosomes constitués de télomères » : différence entre les versions

De EduTech Wiki
Aller à la navigation Aller à la recherche
(Création de la page)
 
(inséré images et complété texte)
Ligne 4 : Ligne 4 :
Ouvrir Genome data Viewer GDV [https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/gdv/ ici]
Ouvrir Genome data Viewer GDV [https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/gdv/ ici]


Choisir une protéine  pour afficher un chromosome (ici le 17 avec l'insuline gène INS)
Choisir une protéine  pour afficher un chromosome (ici le 17 avec le gène TP53)


Décaler le cadre visible à une extrémité en sélectionnant une zone dans le schéma du chromosome ou cliquer dans la barre qui visibilise la séquence et choisir le menu local, Cliquer zoom to sequence, ajuster en cliquant les flèches droire ou gauche.
Décaler le cadre visible à une extrémité en sélectionnant une zone dans le schéma du chromosome ou cliquer dans la barre qui visibilise la séquence
[[Fichier:Zoom-to-telomere-chr7-inGDV.jpg|alt=Menu Local pour zoomer sur la séquence dans GDV- exemple Chr7|vignette|Menu Local pour zoomer sur la séquence dans GDV- exemple Chr7]]
Choisir le menu local.


On voit que la séquence du télomère est indiquée comme NNNNNN…  parce qu'il est impossible (ou très difficile) de séquencer une zone massivement répétée (ce devrait être des répétition tandem  TTAGGG).  
Cliquer zoom to séquence, ajuster en cliquant les flèches droite ou gauche.
 
Ce lien devrait vous y conduire directement :
 
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/gdv/browser/genome/?id=GCF_000001405.39


Ce lien vous y conduit directement : https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/gdv/browser/genome/?id=GCF_000001405.39 


On voit que la séquence du télomère est indiquée comme NNNNNN…  parce qu'il est impossible (ou très difficile) de séquencer une zone massivement répétée (ce devrait être des répétition tandem  TTAGGG).
[[Fichier:Telomere-NNNNN-chr7-inGDV.jpg|alt=Telomère affichant des NNNNN- exemple -chr7-in GDV|vignette|Telomere- affichant des NNNNN- exemple -chr7-in GDV]]


== ''Ce qu'on peut obtenir :  p. ex,  synthèse par un élève des résultats avec une classe ''  ==
== ''Ce qu'on peut obtenir :  p. ex,  synthèse par un élève des résultats avec une classe ''  ==

Version du 18 mai 2020 à 17:48

Éprouver que l'extrémité des chromosomes humains sont constitués de télomères

Procédure

Ouvrir Genome data Viewer GDV ici

Choisir une protéine pour afficher un chromosome (ici le 17 avec le gène TP53)

Décaler le cadre visible à une extrémité en sélectionnant une zone dans le schéma du chromosome ou cliquer dans la barre qui visibilise la séquence

Menu Local pour zoomer sur la séquence dans GDV- exemple Chr7
Menu Local pour zoomer sur la séquence dans GDV- exemple Chr7

Choisir le menu local.

Cliquer zoom to séquence, ajuster en cliquant les flèches droite ou gauche.

Ce lien vous y conduit directement : https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/gdv/browser/genome/?id=GCF_000001405.39

On voit que la séquence du télomère est indiquée comme NNNNNN… parce qu'il est impossible (ou très difficile) de séquencer une zone massivement répétée (ce devrait être des répétition tandem TTAGGG).

Telomère affichant des NNNNN- exemple -chr7-in GDV
Telomere- affichant des NNNNN- exemple -chr7-in GDV

Ce qu'on peut obtenir : p. ex, synthèse par un élève des résultats avec une classe

Scénarios pédagogiques où il peut s'intégrer

Retour à Bioinformatique : opportunités pour l’enseignement