Pääbo-17/8 chap11

Chapitre n°XX, Bareen, Maryam et Zehra

Le chapitre en deux mots

Dans ce chapitre, Pääbo nous parle du début de son projet de séquençage d’ADN de Neandertal. Il lui manque trois éléments pour continuer dans son projet: des machines de séquences 454, fonds financiers et des os néandertaliens de meilleurs qualités. Il rend donc visite à 454 Life Sciences avec son équipe pour signer un contrat de séquençages. Ils décident d'employer la technique du ‘’coups de fusil’’. Avec l’aide d’autres chercheurs, il trouve aussi assez d’aide financière pour son projet. Le groupe fait aussi face à des doutes de contamination car les fragments d'ADN ont été dégradés et ils ne correspondent pas entièrement aux fragments longs de références. Ils ont donc séquencé d’autres fragments qui a laissé place à l’idée qu’il y avait bien de l’ADN ancien de Neandertal présent. Il doit maintenant résoudre le manque des os néandertaliens de bonne qualité.

Mots clés

Séquençage

Contamination

Technique coups de fusils

Os néandertaliens

Fragments d' ADN dégradés

Fragments longs de référence

Aspects

Raisonnement

Comme l'ADN néandertalien est ancien, il a été dégradé donc seuls des fragments courts sont disponibles. Pour la technique que les chercheurs souhaitent utiliser, il est nécessaire d'avoir également des fragments plus longs. Pääbo décide alors de prendre le génome humain comme référencer pour le séquençage. Le problème avec cette approche est qu'elle ne fonctionne pas pour les séquences qui se répètent. Pääbo décide de négliger cela car les parties uniques sont plus intéressantes.De plus, certaines parties du génome ne seraient pas séquencé car les fragments n'existent pas.

Questions

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