Pääbo-17/8 chap23

Chapitre n°XX, Titre du chapitre et prénoms des élèves

Le chapitre en deux mots

==Prise de note: - séquençage d’ADN nucléaire: correspondance près de 70% avec le génome humain - cartographie simplifiée grâce aux innovations d’Adrian Briggs - concurrence avec l’équipe d’Eddy qui travaille aussi sur le séquençage des bibliothèque. - Analyse de l’ADN de la dent qu’Anatoli leur avait donnée pour savoir si celle-ci correspondait au même type d’individus que l’os du petit doigt: Après avoir cherché les fragments d’ADNmt et séquencer des fragments d’ADN choisi au hasard dans les bibliothèque, on constate qu’il y a deux différence entre l’os et le doigt (donc il s’agit de deux individus différents mais de même type), mais aussi que le taux endogène de la dent était seulement de 0,2% alors que ce taux était plus conséquent chez l’ADN de l’os. L’hypothèse proposée par Pääbo et ses équipes est la suivante: ce dernier se serait dessécher rapidement après sa mort réduisant ainsi la dégradation de l'ADN par des enzymes et stoppant la prolifération des bactéries. - Maintenant qu'on sait que la dent provient du même type d'humain que le doigt, Bence se lance dans l'analyse de la morphologie (décrite comme 50% plus grande que les molaire. Il constate des différence de morphologies (présente dans la couronne et dans les racines) qui laissent penser que la population de Denisova était distincte des hommes de Néandertal et des humains modernes. Les ancêtres des individus de Denisova avaient divergé plus tôt. Pour en être sûr, une analyse du génome nucléaire s'imposait. - Cela ne devrait pas prendre trop de temps grâce aux programmes informatiques élaborée pour étudier le génome néandertalien mais Pääbo craignait toujours que la concurrence soit plus rapide. C'est pourquoi, il a confié ce projet à un groupe restreint. - Le consortium X-Woman a trouvé que le génome nucléaire de l'os du doigt de Denisova était plus proche du génome des hommes de Néandertal que celui des hommes d'aujourd'hui. L'hypothèse de flux génétique est une hypothèse raisonnable qui permettrait d'expliquer qu'un flux de gènes venu d'un autre homininé d'Asie, plus ancien, aurait introduit cet ADNmt chez les individus de Denisova. La deuxième découverte repose sur le fait que l'individu de Denisova partage plus d'allèles SNP dérivés avec le Papou qu'avec le Chinois, l'Européen, et les deux Africains. - Ed confirme que X-Woman est bien une femme par la quasi-absence de fragment du chromosome Y et ainsi que la contamination par de l'ADN nucléaire masculin était faible. De plus, il affirme, lorsqu'il examine la divergence des séquences d'ADN de l’individu de Denisova avec le génomes humain et néandertalien, que l'individu de Denisova et l'homme de Néandertal étaient plus proches l'un de l'autre que des humains modernes. - Il est alors évident que ces populations, nommé les Dénisoviens, se sont séparées des Néandertaliens avant que ces derniers aient un lien avec les humains modernes. - Le lien entre les Papou et ces populations reste inexpliqué. C'est pourquoi, il a été nécessaire de séquencer plus d'individus contemporains. Parmi ces individus, on retrouve des individus dont on ne suspecte aucun lien avec les Dénisoviens ( Africain Mbuti, et un européen de Sardaigne)

Questions

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