Lecture Pääbo 17/18

De biorousso
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Généralités et consignes de lecture

Nous allons lire l'ouvrage de Svante Pääbo intitulé Neandertal, à la recherche des génomes perdus (2014). Le Dr. Pääbo est un scientifique de renommée internationale, surtout connu pour les travaux que son équipe et lui ont faits dans le domaine du premier séquençage d'un génome neandertalien.


L'ouvrage proposé est écrit sous la forme d'une sorte de biographique professionnelle. Elle est particulièrement intéressante, car Pääbo aborde trois aspects essentiels de toute démarche scientifique académique:

  1. le raisonnement scientifique qui conduit à des questionnements;
  2. l'utilisation de techniques de laboratoire et de biotechnologies pour répondre à ces questionnements;
  3. la gestion des collaborations, de la diffusion des résultats et de leurs impacts dans le monde académique et public.

Lors de vos lectures, en plus de comprendre les propos de l'auteur, vous devrez mettre en évidence l'existence de ces trois aspects (voir ci-dessous).


La lecture se fera en dehors des heures de cours. Par groupe de deux élèves, vous devrez lire deux chapitres que vous devrez résumer succinctement par écrit sur ce wiki. Vous devrez également faire une courte présentation orale en classe. Le résumé et la présentation en classe devront être structurés selon les consignes ci-dessous. Enfin, une liste de 2-5 questions devra accompagner chaque résumé de chapitre. Ces questions seront traitées en classe et nous en choisirons une dizaine qui nous serviront de base de discussion avec Svante Pääbo que nous rencontrerons en janvier 2018 à Leipzig.

Format des résumés de lecture

Le résumé du livre est réparti entre tous les élèves: par groupe de deux, vous devrez produire un document sur le wiki qui aura la structure suivante:

  1. Chapitre n°XX, Titre du chapitre
  2. Le chapitre en deux mots: vous indiquerez en quelques mots le(s) message(s) essentiel(s) du chapitre
  3. Mots clés: vous indiquerez 2-5 mots clés pour le chapitre. Autrement dit, si vous deviez donner un mot pour expliquer le chapitre, lequel choisiriez-vous?
  4. Aspects
    1. Raisonnement: indiquez les raisonnements logiques proposés par l'auteur et le cheminement intellectuel parcouru pour y arriver. Ce cheminement est en fait l'articulation d'une problématique de recherche qui va conduire le plus souvent l'auteur à proposer une question de recherche à laquelle il souhaite répondre pour faire avancer ses recherches.
    2. Technologies de laboratoire: la réponse aux questions qu'il se pose passe par la mise en place d'expériences et l'utilisation de technologies de laboratoire que vous devrez expliquer succinctement.
    3. Nature des sciences: décrit une approche épistémologique de la biologie, c'est-à-dire une analyse de comment se pratique cette science. Dans son ouvrage, il arrive fréquemment à Pääbo d'expliquer les difficultés rencontrées, les limites ou encore les implications des résultats de ses recherches. Elles peuvent concerner des problèmes de reproductibilité des manipulations, des contaminations qui empêche les scientifiques d'interpréter leurs résultats, de la générations d'artefacts, l'obligations et les contraintes de la mise en place de collaborations multiples, la gestion de la communication au monde scientifique et au grand public des résultats de recherche, aux conséquences sociales et éthiques des découvertes.
  5. Questions: vous devez poser 2-5 questions de compréhension de fond.

Format des présentations orales

Chaque groupe de lecture devra présenter oralement en classe les deux chapitres lus. Chacun des élèves présente un chapitre. Il s'agira pour vous de structurer clairement cette présentation. Cet exercice - qui pourrait être pas noté - est essentiel pour vous permettre de développer des compétences de communications orales et vous préparera à vos examens oraux. Nous vous proposons d'utiliser la structuration suivante pour vos présentations:

  1. Salutations d'usage et indication du n° et titre du chapitre que vous allez présenter: cette partie vous permet simplement de commencer votre présentation, de poser votre voix, de vous rassurer, de faire en sorte que l'audience vous écoute. Vous marquez ainsi officiellement le début de votre présentation.
  2. Plan de votre présentation: en indiquant ce que vous compter aborder oralement, et dans quel ordre, permet aux auditeurs de se faire une idée de ce que vous allez faire. En outre, démontrer ainsi une structuration de vos propos à venir suggère à vos auditeurs que vous maitrisez le sujet, que vous y avez pensé.
  3. Résumez le chapitre en deux mots: vous indiquerez en quelques mots le(s) message(s) essentiel(s) du chapitre
  4. Aspects
    1. Raisonnement: choisissez un raisonnement clé effectué par Pääbo, expliquez le cheminement intellectuel qu'il utilise et aboutissez à la question qu'il se pose.
    2. Technologies de laboratoire: indiquez la technique - ou l'expérience - de laboratoire que Pääbo propose pour répondre à sa question de recherche. Expliquez la technique utilisée pour que vos camarades la comprenne.
    3. Nature des sciences: décrivez les difficultés rencontrées, les limites ou encore les implications des résultats de recherches dont il est question dans le chapitre que vous analysez.
  5. Questions: proposez 2-5 questions de fond que vous souhaitez soumettre à vos camarades pour discussion

Questions à discuter avec Pääbo

Toutes les questions que vous aurez posées dans vos résumés seront reproduites ici. Nous les discuterons en classe et en choisiront une dizaine qui nous serviront de base de discussion avec Pääbo lors de notre visite son laboratoire à Leipzig en janvier 2018.

Evaluation

Le document wiki en tant que tel ne sera pas évalué. Les présentations orales pourraient par contre être sujettes à une évaluation.
Des examens oraux portant sur le livre seront organisés dans le courant du printemps. Ils auront aussi pour but de préparer les élèves à l'examen oral final de la session de maturité. Des éléments principaux du livre feront partie du champ de l'examen écrit de maturité.

La procédure d'évaluation est donc sur plusieurs niveaux:

  1. analyse des chapitres et production d'une document écrit en commun (wiki page)
  2. presentations orales des chapitres étudiés
  3. examens oraux au printemps
  4. examens de maturité

Chapitres

Questions à poser lors du voyage