« Trouver la date de divergence évolutive » : différence entre les versions
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== Trouver la date de divergence évolutive de deux espèces . == | == Trouver la date de divergence évolutive de deux espèces . == | ||
la date de divergence ~ date du plus récent ancêtre commun | la date de divergence ~ date du plus récent ancêtre commun | ||
== Procédure 1 == | == Procédure 1 (Plus près des données authentiques) == | ||
* Ouvrir Timetree http://www.timetree.org/[[Fichier:Timetree.org-sample-screen-homo-chimp.jpg|alt=Exemple d'écran de Timetree.org avec homo-sapiens et chimpanzé|vignette|Exemple d'écran de Timetree.org pour la divergence d''<nowiki/>'Homo sapiens'' et chimpanzé (''Pan troglodytes'')]] | * Ouvrir Timetree http://www.timetree.org/[[Fichier:Timetree.org-sample-screen-homo-chimp.jpg|alt=Exemple d'écran de Timetree.org avec homo-sapiens et chimpanzé|vignette|Exemple d'écran de Timetree.org pour la divergence d''<nowiki/>'Homo sapiens'' et chimpanzé (''Pan troglodytes'')]] | ||
*Choisir ‘node time’ indiquer dans les deux cases les noms (''latins'') des 2 espèces (ou taxons ?) (''Homo sapiens, Pan troglodytes, Mus musculus, Bos taurus,'' etc). | *Choisir ‘node time’ indiquer dans les deux cases les noms (''latins'') des 2 espèces (ou taxons ?) (''Homo sapiens, Pan troglodytes, Mus musculus, Bos taurus,'' etc). | ||
**si il y ambiguité le système propose dans "resolve ambiguity" (les cases juste à coté) | **si il y ambiguité le système propose dans "resolve ambiguity" des choix (les cases juste à coté). | ||
* On obtient la date de divergence, | * On obtient la date de divergence, (encadré en violet dans l'image) à droite d'un graphique (Climate Change Charts). | ||
**Ces paramètres peuvent être activés ou masqués en cliquant les cases sous "Display". | ** Ce graphique indique les principaux paramètres géologiques et physiques à travers les époques (Solar Luminosity, Oxygen Levels, Carbon Dioxide Levels, luminosity, Geo Timescale, Earth Impacts, O<sub>2</sub> Levels CO<sub>2</sub> Levels Luminosity) | ||
***Ces paramètres peuvent être activés ou masqués en cliquant les cases sous "Display". | |||
* On peut alors exporter le graphique | |||
NB : On peut retrouver le nom latin des espèces sur Wikipedia ou sur le site [https://www.uniprot.org/ UniProt/] : Chercher le nom commun anglais (pas français). Puis choisir une entrée qui semble être de la bonne espèce : dans la colonne taxonomie, le nom complet apparaît | NB : On peut retrouver le nom latin des espèces sur Wikipedia ou sur le site [https://www.uniprot.org/ UniProt/] : Chercher le nom commun anglais (pas français). Puis choisir une entrée qui semble être de la bonne espèce : dans la colonne taxonomie, le nom complet apparaît | ||
== Procédure 2 == | == Procédure 2 (Simplifiée pour l'éducation) == | ||
* Ouvrir le site [https://ohmygenes.org/fr/ OhMyGenes] du projet ''In the light of evolution'' du SIB | |||
* Choisir "Créer votre propre mème" | |||
* Sélectionner 2 espèces dans la liste ( p.ex. humain et chimpanzé) | |||
* Cliquer le bouton "données scientifiques". | |||
* On obtient les degrés de similitudes A vs B et B vs.A ainsi qu'un temps de divergence : | |||
** 20038 genes of 20430 (98.1%) from Human shared. 23010 genes of 23534 (97.8%) from Chimpanzee shared. | |||
** Divergence time between Human and Chimpanzee: 6.7 mya (MYA = Million Years Ago) | |||
== Scénarios pédagogiques où il peut s'intégrer == | == Scénarios pédagogiques où il peut s'intégrer == | ||
Dernière version du 22 février 2024 à 19:00
Trouver la date de divergence évolutive de deux espèces .
la date de divergence ~ date du plus récent ancêtre commun
Procédure 1 (Plus près des données authentiques)
- Ouvrir Timetree http://www.timetree.org/
- Choisir ‘node time’ indiquer dans les deux cases les noms (latins) des 2 espèces (ou taxons ?) (Homo sapiens, Pan troglodytes, Mus musculus, Bos taurus, etc).
- si il y ambiguité le système propose dans "resolve ambiguity" des choix (les cases juste à coté).
- On obtient la date de divergence, (encadré en violet dans l'image) à droite d'un graphique (Climate Change Charts).
- Ce graphique indique les principaux paramètres géologiques et physiques à travers les époques (Solar Luminosity, Oxygen Levels, Carbon Dioxide Levels, luminosity, Geo Timescale, Earth Impacts, O2 Levels CO2 Levels Luminosity)
- Ces paramètres peuvent être activés ou masqués en cliquant les cases sous "Display".
- Ce graphique indique les principaux paramètres géologiques et physiques à travers les époques (Solar Luminosity, Oxygen Levels, Carbon Dioxide Levels, luminosity, Geo Timescale, Earth Impacts, O2 Levels CO2 Levels Luminosity)
- On peut alors exporter le graphique
NB : On peut retrouver le nom latin des espèces sur Wikipedia ou sur le site UniProt/ : Chercher le nom commun anglais (pas français). Puis choisir une entrée qui semble être de la bonne espèce : dans la colonne taxonomie, le nom complet apparaît
Procédure 2 (Simplifiée pour l'éducation)
- Ouvrir le site OhMyGenes du projet In the light of evolution du SIB
- Choisir "Créer votre propre mème"
- Sélectionner 2 espèces dans la liste ( p.ex. humain et chimpanzé)
- Cliquer le bouton "données scientifiques".
- On obtient les degrés de similitudes A vs B et B vs.A ainsi qu'un temps de divergence :
- 20038 genes of 20430 (98.1%) from Human shared. 23010 genes of 23534 (97.8%) from Chimpanzee shared.
- Divergence time between Human and Chimpanzee: 6.7 mya (MYA = Million Years Ago)
Scénarios pédagogiques où il peut s'intégrer
Peut compléter : Preuve de l'évolution par la comparaison de protéines chez différentes espèces
Reférences
Scénario établi à partir d'une demande de B. Birbaum et sur la base des indications scientifiques de M.-C. Blatter du SIB