SNP fréquents - changements d'une seule base
1 Éprouver que les SNP sont fréquents et sont des changements d'une seule base par exemple dans le gène CFTR
2 Procédure
Ouvrir Genome data Viewer GDV ici
2.1 Préalable trouver une séquence d'un gène : Séquence du gène de protéines sur chromosomes
- Afficher la séquence d'une protéine à choix : p. ex CFTR
- [Solution]
- Si nécessaire zoomer à la séquence (icone ATG),
- Observer les SNP en bleu noter leur fréquence
- En choisir un (par exemple rs1228922204)
- -> cliquer sur le SNP choisi,
- ou le chercher en introduisant son identifiant dans la case search assembly en haut à gauche [solution] valable 90 jours depuis le 25.09.22
- Repérer la base qui change T<->C dans ce cas
3 Ce qu'on peut obtenir : p. ex, synthèse par un élève des résultats avec une classe
Ajoutez votre exemple
4 Scénarios pédagogiques où il peut s'intégrer
Afin d'aider les élèves à imaginer ce qu'est un SNP, pourrait précéder :
4.1 Références
Scénario établi en partie sur la base des indications scientifiques de M.-C. Blatter du SIB