Les séquences pour les empreintes (satellites) sont des séquences répétées

De EduTech Wiki
Version datée du 1 octobre 2021 à 16:40 par Lombardf (discussion | contributions)
(diff) ← Version précédente | Voir la version actuelle (diff) | Version suivante → (diff)
Aller à la navigation Aller à la recherche

Éprouver que les séquences pour les empreintes (satellites) sont des séquences répétées

Procédure

Ouvrir Genome data Viewer GDV ici Situer l'espèce (p. ex. humaine) dans l'arborescence, puis la choisir.

GdV-HS-parmi-sp.jpg

Un exemple de satellite est sur le chromosome 5 (dès la position 177 326 740 à 177 326 980 environ): voici la séquence dans laquelle on trouve des répétitions de la séquence AAAGAAAG

Observer qu'il n'y a pas d'exons ( -> ~ non codant) cf Éprouver que certains gènes sont constitués d'Introns et d'Exons

Observer le nombre de répétitions, en cliquant les flèches à droite ou à gauche dans la barre grise en dessus de la séquence (pan left et pan right)

Observer la fin et le début en cliquant ces flèches jusqu'à la fin des répétitions

Comparer pour 3 personnes le nombre de répétitions dans un satellite  sur le chr 1

Ce qu'on peut obtenir : p. ex, synthèse par un élève des résultats avec une classe

Scénarios pédagogiques où il peut s'intégrer

Références

Scénario établi en partie sur la base des indications scientifiques de M.-C. Blatter du SIB

Retour à Bioinformatique : opportunités pour l’enseignement