Déterminer les organes exprimant un gène donné

De EduTech Wiki
Aller à la navigation Aller à la recherche

1 Localisation de l'expression d'un gène dans l'organisme

2 Procédure

  • Ouvrir The Human Protein Atlas solution
  • Choisir Tissue -> solution
  • Introduire le nom du gène dont on veut connaître l'expression dans le champ "Search" en haut. P. ex ACE2 -> solution
    Schéma de l'expression de la protéine ACE2-expression dans proteinatlas
    Schéma de l'expression de la protéine ACE2-expression dans proteinatlas
  • Choisir dans la ligne "Angiotensin I converting enzyme 2" la vignette "tissue" -> solution
  • Un schéma du corps humain féminin et masculin affiche en rose et rouge les régions ou s'exprime le gène sélectionné (ACE2 dans ce cas) [1]
  • Plus bas dans la page les organes sont listés et des barres d’histogramme indiquent le degré d'expression du gène (en protéine d'abord,…)

3 Autres liens

  • Activité proposée par le SIB mettant en évidence le rôle de la protéine Spike et la manière dont elle interagit avec ACE2: "La protéine Spike de SARS-CoV-2"

4 Scénarios pédagogiques où il peut s'intégrer

4.1 Références

Scénario établi en partie sur la base des indications scientifiques de M.-C. Blatter du SIB

Retour à Bioinformatique : opportunités pour l’enseignement