Déterminer les organes exprimant un gène donné

Procédure

• Ouvrir The Human Protein Atlas solution
• Choisir Tissue -> solution
• Introduire le nom du gène dont on veut connaître l'expression dans le champ "Search" en haut. P. ex ACE2 -> solution
  

  Schéma de l'expression de la protéine ACE2-expression dans proteinatlas
• Choisir dans la ligne "Angiotensin I converting enzyme 2" la vignette "tissue" -> solution
• Un schéma du corps humain féminin et masculin affiche en rose et rouge les régions ou s'exprime le gène sélectionné (ACE2 dans ce cas) [1]

• Plus bas dans la page les organes sont listés et des barres d’histogramme indiquent le degré d'expression du gène (en protéine d'abord,…)

NB: On voit que ACE2 sur laquelle se fixe Spike du virus SARS-Cov2 est présente à de nombreux endroits du corps et pas seulement dans les voies respiratoires - probablement parce que c'est par là que le virus entre le plus souvent. Mais le site ne visualise pas beaucoup d'expression de ACE2 a ces endroits. La liste n'est pas exhaustive et dépend des données existantes. Par ailleurs ces images peuvent bien expliquer la diversité des organes aussi attaqués par ce virus.

Autres liens

• Activité proposée par le SIB mettant en évidence le rôle de la protéine Spike et la manière dont elle interagit avec ACE2: "La protéine Spike de SARS-CoV-2"

Scénarios pédagogiques où il peut s'intégrer

Références

Scénario établi en partie sur la base des indications scientifiques de M.-C. Blatter du SIB

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