« Déterminer les organes exprimant un gène donné » : différence entre les versions
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* Activité proposée par le SIB mettant en évidence le rôle de la protéine Spike et la manière dont elle interagit avec ACE2: "[http://education.expasy.org/bioinformatique/pdfs/Bioinfo_corona_vs13.pdf#page=37 | * Activité proposée par le SIB mettant en évidence le rôle de la protéine Spike et la manière dont elle interagit avec ACE2: "[http://education.expasy.org/bioinformatique/pdfs/Bioinfo_corona_vs13.pdf#page=37 La protéine Spike de SARS-CoV-2]" | ||
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Version du 8 octobre 2021 à 16:19
Localisation de l'expression d'un gène dans l'organisme
Procédure
- Ouvrir The Human Protein Atlas solution
- Choisir Tissue -> solution
- Introduire le nom du gène dont on veut connaître l'expression dans le champ "Search" en haut. P. ex ACE2 -> solution
- Choisir dans la ligne "Angiotensin I converting enzyme 2" la vignette "tissue" -> solution
- Un schéma du corps humain féminin et masculin affiche en rose et rouge les régions ou s'exprime le gène sélectionné (ACE2 dans ce cas) [1]
![[1]](http://1.bp.blogspot.com/-_xj64ijTtLU/X4QHNYcBiKI/AAAAAAAAMJs/7fVq907buicXxTWE-dFRq9SGVDzVIBu-gCK4BGAYYCw/s320/ACE2-expression-proteinatlas-714136.jpg){kind=link}
- Plus bas dans la page les organes sont listés et des barres d’histogramme indiquent le degré d'expression du gène (en protéine d'abord,…)
Autres liens
- Activité proposée par le SIB mettant en évidence le rôle de la protéine Spike et la manière dont elle interagit avec ACE2: "La protéine Spike de SARS-CoV-2"
Scénarios pédagogiques où il peut s'intégrer
Références
Scénario établi en partie sur la base des indications scientifiques de M.-C. Blatter du SIB