« Déterminer les organes exprimant un gène donné » : différence entre les versions

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== Déterminer quels tissus expriment un gène (humain) donné ==
== Localisation de l'expression d'un gène dans l'organisme ==


== Procédure ==
== Procédure ==
* Ouvrir The Human Protein Atlas  [https://www.proteinatlas.org/ solution]
* Ouvrir The Human Protein Atlas  [https://www.proteinatlas.org/ solution]
* Choisir Tissue [https://www.proteinatlas.org/humanproteome/tissue -> solution]  
* Choisir Tissue [https://www.proteinatlas.org/humanproteome/tissue -> solution]  
* Introduire le nom du gène dont on veut connaître l'expression  dans le champ "Search" en haut. P. ex [https://www.proteinatlas.org/search/ACE2 ACE2 -> solution]
* Introduire le nom du gène dont on veut connaître l'expression  dans le champ "Search" en haut. P. ex [https://www.proteinatlas.org/search/ACE2 ACE2 -> solution][[Fichier:ACE2-expression-schema-from-proteinatlas.jpg|alt=Schéma de l'expression de la protéine ACE2-expression dans proteinatlas|vignette|Schéma de l'expression de la protéine ACE2-expression dans proteinatlas]]
* Choisir dans la ligne Angiotensin I converting enzyme 2 l'icone  [https://www.proteinatlas.org/ENSG00000130234-ACE2/tissue tissue -> solution]
* Choisir dans la ligne Angiotensin I converting enzyme 2 l'icone  [https://www.proteinatlas.org/ENSG00000130234-ACE2/tissue tissue -> solution]
* un schéma du corps humain féminin et masculin affiche en rose et rouge les régions ou s'exprime le gène sélectionné (ACE2 dans ce cas)  [http://1.bp.blogspot.com/-_xj64ijTtLU/X4QHNYcBiKI/AAAAAAAAMJs/7fVq907buicXxTWE-dFRq9SGVDzVIBu-gCK4BGAYYCw/s320/ACE2-expression-proteinatlas-714136.jpg]
* Un schéma du corps humain féminin et masculin affiche en rose et rouge les régions ou s'exprime le gène sélectionné (ACE2 dans ce cas)  [http://1.bp.blogspot.com/-_xj64ijTtLU/X4QHNYcBiKI/AAAAAAAAMJs/7fVq907buicXxTWE-dFRq9SGVDzVIBu-gCK4BGAYYCw/s320/ACE2-expression-proteinatlas-714136.jpg]


* Plus bas les organes sont listés et des barres d’histogramme indiquent le degré d'expression du gène (en protéine d'abord,…)  
* Plus bas les organes sont listés et des barres d’histogramme indiquent le degré d'expression du gène (en protéine d'abord,…)  

Version du 22 octobre 2020 à 15:28

Localisation de l'expression d'un gène dans l'organisme

Procédure

  • Ouvrir The Human Protein Atlas solution
  • Choisir Tissue -> solution
  • Introduire le nom du gène dont on veut connaître l'expression dans le champ "Search" en haut. P. ex ACE2 -> solution
    Schéma de l'expression de la protéine ACE2-expression dans proteinatlas
    Schéma de l'expression de la protéine ACE2-expression dans proteinatlas
  • Choisir dans la ligne Angiotensin I converting enzyme 2 l'icone tissue -> solution
  • Un schéma du corps humain féminin et masculin affiche en rose et rouge les régions ou s'exprime le gène sélectionné (ACE2 dans ce cas) [1]
  • Plus bas les organes sont listés et des barres d’histogramme indiquent le degré d'expression du gène (en protéine d'abord,…)


Ce qu'on peut obtenir : p. ex, synthèse par un élève des résultats avec une classe

Scénarios pédagogiques où il peut s'intégrer

Retour à Bioinformatique : opportunités pour l’enseignement