Choisir les sondes pour tester SNP sur micro-array

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1 Savoir choisir les sondes pour déterminer chaque SNP étudié dans une puce à ADN (µ-array)

2 Procédure

Séquence du gène CFTR dans GDV avec un snp (rs 113993960) mis en évidence
Séquence du gène CFTR dans GDV avec un snp (rs 113993960) mis en évidence
  • Noter la séquence de référence et celle du SNP (quelques bases de chaque coté pour un total de 25 environ)

-> comment établir des sondes pour le Micro-array

NB: cette procédure simplifiée pour les élèves n'est pas complète : Si elle cible bien ce SNP, il faudrait encore vérifier que cette séquence est effectivement unique dans le génome - qu'on ne la trouve nulle part ailleurs.

3 Ce qu'on peut obtenir : p. ex, synthèse par un élève des résultats avec une classe

4 Scénarios pédagogiques où il peut s'intégrer

4.1 Références

Scénario établi en partie sur la base des indications scientifiques de M.-C. Blatter du SIB

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