« Choisir les sondes pour tester SNP sur micro-array » : différence entre les versions
Aller à la navigation
Aller à la recherche
mAucun résumé des modifications |
m (typo) |
||
Ligne 6 : | Ligne 6 : | ||
Prenez un exemple concret à partir d'un SNP par exemple dans le gène CFTR | Prenez un exemple concret à partir d'un SNP par exemple dans le gène CFTR | ||
Trouver le gène | Trouver le gène CFTR voir ici | ||
[[S%C3%A9quence_du_g%C3%A8ne_de_prot%C3%A9ines_sur_chromosomes]] | [[S%C3%A9quence_du_g%C3%A8ne_de_prot%C3%A9ines_sur_chromosomes]] | ||
Version du 14 mai 2020 à 15:33
Savoir choisir les sondes pour déterminer chaque SNP étudié dans une puce à ADN (µ-array)
Procédure
Ouvrir Genome data Viewer GDV ici
Prenez un exemple concret à partir d'un SNP par exemple dans le gène CFTR
Trouver le gène CFTR voir ici Séquence_du_gène_de_protéines_sur_chromosomes
si nécessaire zoomer à la séquence, choisir un snp par exemple rs1228922204 selon ce protocole SNP_fréquents_-_changements_d'une_seule_base
Noter la séquence de référence et celle du SNP (quelques bases de chaque coté pour un total de 25 environ)
-> établir des sondes pour le Micro-array
NB: cette procédure simplifiée pour les élèves n'est pas complète : il faudrait encore vérifier que ces séquences sont effectivement uniques.