« Bioinformatique : opportunités pour l’enseignement » : différence entre les versions
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* Des activités en classe ou de type TP / laboratoire virtuel ou les élèves peuvent vérifier des hypothèses et construire des connaissances en se basant sur les savoirs les plus récents | * Des activités en classe ou de type TP / laboratoire virtuel ou les élèves peuvent vérifier des hypothèses et construire des connaissances en se basant sur les savoirs les plus récents | ||
===== Des protocoles-élève ===== | |||
*# [[Séquence du gène de protéines sur chromosomes|Éprouver que la séquence du gène de quelques protéines est repérable sur les chromosomes humains.]] | *# [[Séquence du gène de protéines sur chromosomes|Éprouver que la séquence du gène de quelques protéines est repérable sur les chromosomes humains.]] | ||
*# [[Séquence gène constituée ATCG|Éprouver que la séquence du gène de quelques protéines est bien constituée de ATCG]] | *# [[Séquence gène constituée ATCG|Éprouver que la séquence du gène de quelques protéines est bien constituée de ATCG]] | ||
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*#* Des Liste de protéines sélectionnées, de structures 3D prêtes à imprimer | |||
*# [[Convertir la structure de la protéine en fichier pour imprimante 3D]](.STL) | *# [[Convertir la structure de la protéine en fichier pour imprimante 3D]](.STL) | ||
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*# [[Prédire la répartition des espèces à partir de mesures et des valeurs écologiques ?|Peut-on prédire la répartition des espèces végétales à partir de mesures physicochimiques et des valeurs écologiques Landolt ? (et réciproquement ?)]] | *# [[Prédire la répartition des espèces à partir de mesures et des valeurs écologiques ?|Peut-on prédire la répartition des espèces végétales à partir de mesures physicochimiques et des valeurs écologiques Landolt ? (et réciproquement ?)]] | ||
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===== Des exemples de progressions possibles en articulant ces activités ===== | |||
===== Des listes de questions pour guider les activités et les évaluations ===== | |||
Encore en rédaction | |||
===== D'autres activités Bioinformatique @ SIB ===== | |||
** [http://education.expasy.org/bioinformatique/Atelier1.html Des chromosomes et des gènes] | ** [http://education.expasy.org/bioinformatique/Atelier1.html Des chromosomes et des gènes] | ||
** [http://education.expasy.org/bioinformatique/Atelier2.html Protéines et Drug Design] | ** [http://education.expasy.org/bioinformatique/Atelier2.html Protéines et Drug Design] | ||
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** [http://education.expasy.org/bioinformatique/gout_amer.html La génétique d'un goût amer...]@ SIB | ** [http://education.expasy.org/bioinformatique/gout_amer.html La génétique d'un goût amer...]@ SIB | ||
** [http://education.expasy.org/bioinformatique/Coronavirus_proteines.html Atelier coronavirus] | ** [http://education.expasy.org/bioinformatique/Coronavirus_proteines.html Atelier coronavirus] | ||
===== Une sélection de sites pour les enseignants ===== | |||
* Des Liste de protéines sélectionnées, de structures 3D prêtes à imprimer | * Des Liste de protéines sélectionnées, de structures 3D prêtes à imprimer | ||
===== Des liens vers des sources d'information ===== | |||
** Sars-Cov2 et Covid : | ** Sars-Cov2 et Covid : | ||
*** Suivi des souches du virus en fonction du lieu et du temps : [https://nextstrain.org/ncov/global Nextstrain, Real-time tracking of pathogen evolution] | *** Suivi des souches du virus en fonction du lieu et du temps : [https://nextstrain.org/ncov/global Nextstrain, Real-time tracking of pathogen evolution] | ||
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[[Catégorie: BioInfoScenarios]] | [[Catégorie: BioInfoScenarios]] | ||
Version du 25 octobre 2020 à 17:21
1Projet ESII Le numérique en biologie (Bioinformatique) : opportunités pour l’enseignement
Cette page peut être atteinte directement par http://tinyurl.com/bioinfoEduTechWiki ou http://unige.ch/-/bioinformatique
- Des activités en classe ou de type TP / laboratoire virtuel ou les élèves peuvent vérifier des hypothèses et construire des connaissances en se basant sur les savoirs les plus récents
Des protocoles-élève
- Éprouver que la séquence du gène de quelques protéines est repérable sur les chromosomes humains.
- Éprouver que la séquence du gène de quelques protéines est bien constituée de ATCG
- Éprouver qu'une grande partie du génome n'est pas constituée de gènes
- Éprouver que certains gènes sont constitués d'Introns et d'Exons
- Éprouver que la limite introns-exons n'est pas discernable aisément
- Éprouver que l'origine de réplication est une séquence de bases
- Éprouver que les SNP sont fréquents et sont des changements d'une seule base par exemple dans le gène CFTR
- Savoir choisir les sondes pour déterminer chaque SNP étudié dans une puce à ADN (µ-array)
- Éprouver comment on pourrait choisir les sondes pour déterminer un SNP spécifique ( la ∂F508 cause la plus fréquente de la mucoviscidose) dans une puce à ADN (µ-array)
- Estimer la taille minimale permettant de retrouver spécifiquement une séquence.
- Éprouver que les séquences pour les empreintes (satellites) sont des séquences répétées
- Comparer pour 3 personnes le nombre de répétitions dans un satellite sur le chr 1
- Variante Former un schéma du gel pour une empreinte ADN à partir des séquences sur le chromosome 1 pour 3 personnes
- Éprouver que l'extrémité des chromosomes humains sont constitués de télomères
- Déterminer les tissus et organes exprimant un gène (humain) donné
- Déterminer le degré d'expression d'un gène selon les organes au cours de l'embryogenèse (souris)
- Preuve de l'évolution par la comparaison de protéines chez différentes espèces
- Déterminer la structure 3D d'une protéine biologiquement importante
- Des Liste de protéines sélectionnées, de structures 3D prêtes à imprimer
- Convertir la structure de la protéine en fichier pour imprimante 3D(.STL)
- Éprouver le lien entre structure, séquence et fonction d'une protéine
- Peut-on prédire la répartition des espèces végétales à partir de mesures physicochimiques et des valeurs écologiques Landolt ? (et réciproquement ?)
Des exemples de progressions possibles en articulant ces activités
Des listes de questions pour guider les activités et les évaluations
Encore en rédaction
D'autres activités Bioinformatique @ SIB
- Des chromosomes et des gènes
- Protéines et Drug Design
- Phylogénie, biodiversité et pizza ...
- Médecine de précision et profil génétique
- Coronavirus et protéines...
- Découverte de BLAST...
- L'insuline de A à Z
- Quelques liens Pour les plus curieux......
- La génétique d'un goût amer...@ SIB
- Atelier coronavirus
Une sélection de sites pour les enseignants
- Des Liste de protéines sélectionnées, de structures 3D prêtes à imprimer
Des liens vers des sources d'information
- Sars-Cov2 et Covid :
- Suivi des souches du virus en fonction du lieu et du temps : Nextstrain, Real-time tracking of pathogen evolution
- Sars-Cov2 et Covid :