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==== [https://outil.ge.ch/site/formation/rh/PO-425.html Formation continue PO 425] du 20 octobre 2021. ====
===== Remerciements =====
Se connecter à 13h30 avec le lien fourni par email (accès possible par Zoom dans le browser)  
Le DIP ESII pour le soutien à ce projet, le SIB Institut Suisse de Bioinformatique pour les collaborations depuis 2002. 
 
[https://outils.ge.ch/referentiel/formation/CatalogueDescription/PO-425.html Formation continue PO 425] du 28 février 2024.  
 
Programme : 
 
* 13h30 Présentations et Introduction (FL)
* 13h50
** Activités sur l'évolution : 2 approches pédagogiques (MCB, puis FL)
** Activités sur l'ADN  : 2 approches pédagogiques (MCB, puis FL)
* 14h10 Présentation d'une sélection de scénarios et survol des autres scénarios (FL)
* 14h30 Présentation d'une sélection d'activités produites par le SIB et survol des autres (MCB) (documents)
* 15h Pause
* 15h15 Ateliers à choix en parallèle a) activités SIB (MCB) b) scénarios en classe (FL)
* 16h30 Synthèse et bilan
* 17h Fin


===== Remerciements =====
Documents proposés
Le DIP ESII pour le soutien à ce projet, le SIB Institut Suisse de Bioinformatique pour les collaborations depuis 2002.  
* [http://tecfa.unige.ch/perso/lombardf/formcont/biolonumerique/Bio-numerique-intro-28II24.pdf Introduction] (FL)
* [https://education.expasy.org/cours/PO425/ Introduction et documents] (MCB)
* Articles mentionnés
** L'Intelligence Artificielle et l'éducation... une menace sur les activités et l'évaluation ? Jump-To-Science[https://jump-to-science.unige.ch/2024/01/23/ia-et-education-menace-ou-opportunites-quelques-reflexions/ ici]
** Duncan, R. G., Krishnamoorthy, R., Harms, U., Haskel-Ittah, M., Kampourakis, K., Gericke, N., Hammann, M., Jimenez-Aleixandre, M., Nehm, R. H., Reiss, M. J., & Yarden, A. (2024). The sociopolitical in human genetics education. Science, 383(6685), 826‑828. https://doi.org/10.1126/science.adi8227
** Allchin, D., Bergstrom, C. T., & Osborne, J. (2024). Transforming Science Education in an Age of Misinformation. Journal of College Science Teaching. https://www.tandfonline.com/doi/full/10.1080/0047231X.2023.2292409
** Erduran, S. (2023). AI is transforming how science is done. Science education must reflect this change. Science, 382(6677), eadm9788. https://doi.org/10.1126/science.adm9788


==== Projet ESII Le numérique en biologie (Bioinformatique) : opportunités pour l’enseignement ====
==== Projet ESII Le numérique en biologie (Bioinformatique) : opportunités pour l’enseignement ====
Des activités en classe ou de type TP / laboratoire virtuel ou les élèves peuvent vérifier des hypothèses et construire des connaissances en se basant sur les savoirs les plus récents
Des activités en classe ou de type TP / laboratoire virtuel ou les élèves peuvent vérifier des hypothèses et construire des connaissances en se basant sur les savoirs les plus récents


===== Des scénarios - protocoles (comment faire)   =====
===== Des scénarios - protocoles (~ ''comment faire'') =====
Principalement techniques, le niveau de formulation et la pédagogie peut être adaptés en fonction du public et des approches de l'enseignant.e.
Principalement techniques, le niveau de formulation et la pédagogie peuvent être adaptés en fonction du public et des approches de l'enseignant.e.
*# [[Séquence du gène de protéines sur chromosomes|Éprouver que la séquence des gènes codant pour les protéines est repérable sur les chromosomes humains (quelques exemples).]]
# [[Séquence du gène de protéines sur chromosomes|Éprouver que la séquence des gènes codant pour les protéines est repérable sur les chromosomes humains (quelques exemples).]]
*# [[Séquence gène constituée ATCG|Éprouver que la séquence]] des gènes codant pour les protéines est bien constituée de ATCG (quelques exemples)
# [[Séquence gène constituée ATCG|Éprouver que la séquence]] des gènes codant pour les protéines est bien constituée de ATCG (quelques exemples)
*# [[Génome pas constitué de gènes seulement|Éprouver qu'une grande partie du génome n'est pas constituée de gènes]]  
# [[Génome pas constitué de gènes seulement|Éprouver qu'une grande partie du génome n'est pas constituée de gènes]]  
*# [[Gènes constitués d'Introns et d'Exons|Éprouver que beaucoup de gènes sont constitués d'Introns et d'Exons]]
# [[Gènes constitués d'Introns et d'Exons|Éprouver que beaucoup de gènes codant pour les protéines sont constitués d'Introns et d'Exons]]
*# [[Limite introns-exons pas discernable|Éprouver que la limite introns-exons n'est pas discernable aisément]]
# [[Limite introns-exons pas discernable|Éprouver que la limite introns-exons n'est pas discernable aisément]]
*# [[Éprouver que l'origine de réplication est une séquence de bases|Éprouver que l'origine de transcription est une séquence de bases]]  
# [[Éprouver que l'origine de réplication est une séquence de bases|Éprouver que l'origine de transcription est une séquence de bases]]  
*# [[SNP fréquents - changements d'une seule base|Éprouver que les SNP sont fréquents et sont des changements d'une seule base par exemple dans le gène CFTR]]
# [[SNP fréquents - changements d'une seule base|Éprouver que les SNP sont fréquents et sont des changements d'une seule base par exemple dans le gène CFTR]]
*# [[Choisir les sondes pour tester SNP sur micro-array|Savoir choisir les sondes pour déterminer chaque SNP étudié dans une puce à ADN (µ-array)]]
# [[Choisir les sondes pour tester SNP sur micro-array|Savoir choisir les sondes pour déterminer chaque SNP étudié dans une puce à ADN (µ-array)]]
*# [[Choisir les sondes pour déterminer un SNP spécifique dans une puce à ADN (µ-array)|Éprouver comment on pourrait choisir les sondes pour  déterminer un SNP spécifique ( la ∂F508 cause la plus fréquente de la mucoviscidose)  dans une puce à ADN (µ-array)]]
# [[Choisir les sondes pour déterminer un SNP spécifique dans une puce à ADN (µ-array)|Éprouver comment on pourrait choisir les sondes pour  déterminer un SNP spécifique dans une puce à ADN (µ-array)]]
*# [[Estimer la taille minimale permettant de retrouver spécifiquement une séquence.|Estimer la taille minimale permettant de retrouver spécifiquement une séquence.]]
## [[Choisir les sondes pour déterminer un SNP spécifique dans une puce à ADN (µ-array)#Déterminer un SNP spécifique (la ∂F508 cause la plus fréquente de la mucoviscidose), ses caractéristiques, sa structure pour l'imprimer|Eprouver comment un SNP (mutation ∂F508) est la cause la plus fréquente de mucoviscidose)]]
*# [[Les séquences pour les empreintes (satellites) sont des séquences répétées|Éprouver que les séquences pour les empreintes (satellites) sont des séquences répétées]]
# [[Estimer la taille minimale permettant de retrouver spécifiquement une séquence.|Estimer la taille minimale permettant de retrouver spécifiquement une séquence.]]
*# [[Comparer pour 3 personnes le nombre de répétitions dans un  satellite  sur le chr 1]]
# [[Les séquences pour les empreintes (satellites) sont des séquences répétées|Éprouver que les séquences pour les empreintes (satellites) sont des séquences répétées]]
*# [[Former un schéma du gel pour une empreinte ADN à partir des séquences répétées|Variante  Former un schéma du gel pour  une empreinte ADN à partir des séquences sur le chromosome 1 pour 3 personnes]]
# [[Comparer pour 3 personnes le nombre de répétitions dans un  satellite  sur le chr 1]]
*# [[L'extrémité des chromosomes constitués de télomères|Éprouver que l'extrémité des chromosomes humains sont constitués de télomères]]
# [[Former un schéma du gel pour une empreinte ADN à partir des séquences répétées|Variante  Former un schéma du gel pour  une empreinte ADN à partir des séquences sur le chromosome 1 pour 3 personnes]]
*# [[Déterminer les organes exprimant un gène donné|Déterminer les tissus et organes exprimant un gène (humain) donné]]  
# [[L'extrémité des chromosomes constitués de télomères|Éprouver que l'extrémité des chromosomes humains sont constitués de télomères]]
*# [[Expression d'un gène selon les organes au cours de l'embryogenèse|Déterminer le degré d'expression d'un gène selon les organes au cours de l'embryogenèse (souris)]]  
# [[Déterminer les organes exprimant un gène donné|Déterminer les tissus et organes exprimant un gène (humain) donné]]  
*# [[Preuve de l'évolution par la comparaison de protéines chez différentes espèces]]
# [[Expression d'un gène selon les organes au cours de l'embryogenèse|Déterminer le degré d'expression d'un gène selon les organes au cours de l'embryogenèse (souris)]]  
*# [[Etablir l'alignement et une phylogénie]]
# [[Preuve de l'évolution par la comparaison de protéines chez différentes espèces]]
*# [[Trouver la date de divergence évolutive|Trouver la date de divergence évolutive de deux espèces]]
# [[Etablir l'alignement et une phylogénie]]
*# [[Déterminer la structure 3D d'une protéine biologiquement importante|Déterminer la structure 3D d'une protéine biologiquement importante]]
# [[Trouver la date de divergence évolutive|Trouver la date de divergence évolutive de deux espèces]]
*# [[Convertir la structure de la protéine en fichier pour imprimante 3D]](.STL)
# [[Déterminer la structure 3D d'une protéine biologiquement importante|Déterminer la structure 3D d'une protéine biologiquement importante]]
*# [[Éprouver le lien entre  structure, séquence et fonction d'une protéine]]
# [[Convertir la structure de la protéine en fichier pour imprimante 3D]](.STL)
*# [[Prédire la répartition des espèces à partir de mesures et des valeurs écologiques ?|Peut-on prédire la répartition des espèces végétales à partir de  mesures physicochimiques et des valeurs écologiques  Landolt ? (et réciproquement ?)]]  
# [[Éprouver le lien entre  structure, séquence et fonction d'une protéine]]
*# [[Eprouver le rôle central des protéines dans le fonctionnement normal et la maladie|Éprouver le rôle central des protéines dans le fonctionnement normal et la maladie]]   
# [[Prédire la répartition des espèces à partir de mesures et des valeurs écologiques ?|Peut-on prédire la répartition des espèces végétales à partir de  mesures physicochimiques et des valeurs écologiques  Landolt ? (et réciproquement ?)]]  
*# [[Trouver des séquences virales dans le génome humain]]
# [[Eprouver le rôle central des protéines dans le fonctionnement normal et la maladie|Éprouver le rôle central des protéines dans le fonctionnement normal et la maladie]]   
# [[Trouver des séquences virales dans le génome humain]]


===== Des exemples d'insertions possibles dans les programmes  =====
===== Des exemples d'insertions possibles dans les programmes  =====
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===== Activités et ressources proposées par le SIB Institut Suisse de Bioinformatique =====
===== Activités et ressources proposées par le SIB Institut Suisse de Bioinformatique =====
*[http://education.expasy.org/bioinformatique/ Ateliers de bioinformatique]
*[http://education.expasy.org/bioinformatique/ '''Ateliers de bioinformatique''']
** [http://education.expasy.org/bioinformatique/Atelier1.html SIB-1. Des chromosomes et des gènes]
**[http://education.expasy.org/bioinformatique/Atelier1.html Atelier-1. Des chromosomes et des gènes]: localiser des gènes sur les chromosomes
** [http://education.expasy.org/bioinformatique/Atelier2.html SIB-2. Protéines et Drug Design]
** [http://education.expasy.org/bioinformatique/Atelier2.html Atelier-2. Protéines et Drug Design]: concevoir des médicaments avec l'aide de l'ordinateur
** [http://education.expasy.org/bioinformatique/Atelier3.html SIB-3. Phylogénie, biodiversité et pizza ...]
*** Une publication (EN) qui reprend toutes les activités en détail [https://f1000research.com/documents/9-1412 (lien)]
*** [http://education.expasy.org/bioinformatique/PizzaMetagenomic.html '''Pizza métagénomqiue''']
** [http://education.expasy.org/bioinformatique/Atelier3.html Atelier-3. Phylogénie, biodiversité et pizza ...]
** [http://education.expasy.org/bioinformatique/pdfs/A_vous_de_jouer.pdf SIB-4. Médecine de précision et profil génétique]
***[http://education.expasy.org/bioinformatique/PizzaMetagenomic.html '''Pizza métagénomique''']: identifier les espèces présentes dans une pizza
** [http://education.expasy.org/bioinformatique/Coronavirus_proteines_vs2.html SIB-5. Coronavirus et protéines...]
** [http://education.expasy.org/bioinformatique/pdfs/A_vous_de_jouer.pdf Atelier-4. Médecine de précision]: choisir un traitement en fonction d'un profil génétique
*** Une publication (EN) qui reprend toutes les activités ci-dessous en détail [https://f1000research.com/documents/10-836 (lien)]
** [http://education.expasy.org/bioinformatique/Coronavirus_proteines_vs2.html Atelier-5. '''Coronavirus et protéines.'''..]
**** Le génome de SARS-CoV-2 ([http://education.expasy.org/bioinformatique/pdfs/Bioinfo_corona_vs13.pdf#page=15 p.15])
*** Une publication (EN) qui reprend toutes les activités [https://f1000research.com/documents/10-836 (lien)]
****Détection du virus: le test RT-PCR ([http://education.expasy.org/bioinformatique/pdfs/Bioinfo_corona_vs13.pdf#page=18 p.18])
** [http://education.expasy.org/bioinformatique/Atelier6.html Atelier-6. Découverte de BLAST...]
****Les génomes de SARS-CoV-2: comparer et trouver les mutations ([http://education.expasy.org/bioinformatique/pdfs/Bioinfo_corona_vs13.pdf#page=27 p.27])
** [http://education.expasy.org/bioinformatique/journee_diabete_3.html Atelier-7. '''L'insuline de A à Z''']: mieux comprendre une maladie génétique grâce à la bioinformatique
****Les protéines de SARS-CoV-2: le rôle de la protéine spike dans la pandémie ([http://education.expasy.org/bioinformatique/pdfs/Bioinfo_corona_vs13.pdf#page=34 p.34])
*** Une publication (EN) qui reprend toutes les activités [https://f1000research.com/documents/8-272 (lien)]
****Spike: de la séquence à la structure 3D: comprendre l'impact des mutations (infectivité et vaccin) ([http://education.expasy.org/bioinformatique/pdfs/Bioinfo_corona_vs13.pdf#page=52 p.52])
** [http://education.expasy.org/bioinformatique/Liens.html Atelier-8. Quelques liens pour les plus curieux]......
****A la recherche de l'origine de SARS-CoV-2 (chauve-souris ou pangolin ?) [http://education.expasy.org/bioinformatique/pdfs/Bioinfo_corona_vs13.pdf#page.3D61 (p.61])
***[http://education.expasy.org/bioinformatique/Atelier_Decouverte.html '''Atelier découverte de la bioinformatique pour les plus jeunes''']
****A la recherche d'un traitement ([http://education.expasy.org/bioinformatique/pdfs/Bioinfo_corona_vs13.pdf#page=72 p.72])
* '''SIB web sites''':
****SARS-CoV-2 et HIV: un exemple de fake news ? ([http://education.expasy.org/bioinformatique/pdfs/Bioinfo_corona_vs13.pdf#page=94 p.94])
**[https://www.chromosomewalk.ch/liste-chromosomes/ '''ChromosomeWalk.ch''']: localisation chromosomique et fonction biologique de plus de 300 gènes humains
** [http://education.expasy.org/bioinformatique/Atelier6.html SIB-6. Découverte de BLAST...]
**[https://www.precisionmed.ch/ PrecisionMed.ch]: la médecine de précision en oncologie
** [http://education.expasy.org/bioinformatique/journee_diabete_3.html SIB-7. L'insuline de A à Z]  
***[https://www.precisionmed.ch/cest-quoi-un-cancer/ C'est quoi un cancer]
** [http://education.expasy.org/bioinformatique/Liens.html SIB-8. Quelques liens pour les plus  curieux]......
***[https://www.precisionmed.ch/cest-quoi-une-proteine/ C'est quoi une protéine]
*** [http://education.expasy.org/bioinformatique/gout_amer_TecDay.html La génétique d'un goût amer...]
**[https://www.atelier-drug-design.ch/ Atelier Drug Design]: concevoir les médicaments de demain avec l'aide de l'ordinateur
**[http://education.expasy.org/bioinformatique/Atelier_Decouverte.html '''Atelier découverte de la bioinformatique pour les plus jeunes''']  
**[https://lightofevolution.org/ '''LightOfEvolution.org''']: des histoires et des activités en lien avec l'évolution
** SIB-9. Les différentes cellules et compartiments cellulaires: [https://www.swissbiopics.org www.swissbiopics.org]
***[https://doi.org/10.1093/biomethods/bpad040 Publication]: Bringing science to the public in the light of evolution
** SIB-10. Comprendre la bioinformatique: les principales banques de données et outils utilisés. [http://education.expasy.org/cours/Outreach/FormCont_04112020/ Présentation lors de la FC SEM 10708 ici]
***[https://lightofevolution.org/banana-split/ '''BananaSplit''']: L'homme et la banane ont 27 % de gènes en commun
****[https://ohmygenes.org/ OhMyGenes.org]: calculer le pourcentages de gènes en commun entre différentes espèces et leur date de divergence
****[https://education.expasy.org/cours/Outreach/LOE/ Atelier 'des séquences de protéines à l'arbre phylogénétique': matériel et instructions]
***[https://lightofevolution.org/ce-qui-peut-faire-une-difference/ Ce qui peut faire une différence]: les variations génétiques humaines à la lumière de l'évolution
****[https://lightofevolution.org/ce-qui-peut-faire-une-difference-a-vous-de-jouer/ Découvrir l'impact de quelques variations génétiques bien connues]
***[https://lightofevolution.org/chasse-aux-variants/ Chasse aux variants]: suivre la pandémie du coronavirus
***[https://lightofevolution.org/dinopoulet/ Dinopoulet]: étudier le lien évolutif entre les dinosaures et les oiseaux
***[https://lightofevolution.org/les-mysteres-des-anciens-grecs/ Les Mystères des grecs anciens]: comment étudier les migrations des anciennes populations humaines
***[https://lightofevolution.org/des-genes-en-bonus/ Des gènes en bonus]: des exemples de transferts de gènes horizontaux et leur rôle dans la reproduction sexuée
***[https://lightofevolution.org/cancerevolution/ Cancer(r)évolution]: le cancer à la lumière de l'évolution
**[https://education.expasy.org/cgi-bin/philophylo/philophylo.cgi '''PhiloPhylo''']: construire des alignements de séquences et des arbres phylogénétiques facilement
**[[www.uniprot.org]]: banques de données sur les protéines
**[https://www.swissbiopics.org www.swissbiopics.org]: des illustrations des différentes cellules et de leurs compartiments
**[https://nextstrain.org/ Nextstrain.org]: le suivi des pandémies
***[https://nextstrain.org/ncov/gisaid/global/6m Genomic epidemiology of SARS-CoV-2]
** Protein Spotlight comics (bande dessinée sur les protéines, EN/FR): https://www.proteinspotlight.org/comics/


===== Glossaire =====
===== Glossaire =====
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|http://www.timetree.org/
|http://www.timetree.org/
|Trouver la date de divergence entre deux espèces ( nom latin)  
|Trouver la date de divergence entre deux espèces ( nom latin)  
|-
|ClustalW
|https://embnet.vital-it.ch/software/ClustalW.html
|Produit des alignements multiples (ADN ou protéines)
|-
|-
|Bioinformatics @ NCBI
|Bioinformatics @ NCBI
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Tutorials sur Le BLAST, Entrez, Cn3D, etc
Tutorials sur Le BLAST, Entrez, Cn3D, etc
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|}
* SARS-CoV-2 et COVID-19 :
**  
** Suivi des souches du virus en fonction du lieu et du temps : [https://nextstrain.org/ncov/global Nextstrain.org, Real-time tracking of pathogen evolution] 
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[[Catégorie: BioInfoScenarios]]
[[Catégorie: BioInfoScenarios]]

Dernière version du 28 février 2024 à 08:07

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Remerciements

Le DIP ESII pour le soutien à ce projet, le SIB Institut Suisse de Bioinformatique pour les collaborations depuis 2002.

Formation continue PO 425 du 28 février 2024.

Programme :

  • 13h30 Présentations et Introduction (FL)
  • 13h50
    • Activités sur l'évolution : 2 approches pédagogiques (MCB, puis FL)
    • Activités sur l'ADN  : 2 approches pédagogiques (MCB, puis FL)
  • 14h10 Présentation d'une sélection de scénarios et survol des autres scénarios (FL)
  • 14h30 Présentation d'une sélection d'activités produites par le SIB et survol des autres (MCB) (documents)
  • 15h Pause
  • 15h15 Ateliers à choix en parallèle a) activités SIB (MCB) b) scénarios en classe (FL)
  • 16h30 Synthèse et bilan
  • 17h Fin

Documents proposés

Projet ESII Le numérique en biologie (Bioinformatique) : opportunités pour l’enseignement

Des activités en classe ou de type TP / laboratoire virtuel ou les élèves peuvent vérifier des hypothèses et construire des connaissances en se basant sur les savoirs les plus récents

Des scénarios - protocoles (~ comment faire)

Principalement techniques, le niveau de formulation et la pédagogie peuvent être adaptés en fonction du public et des approches de l'enseignant.e.

  1. Éprouver que la séquence des gènes codant pour les protéines est repérable sur les chromosomes humains (quelques exemples).
  2. Éprouver que la séquence des gènes codant pour les protéines est bien constituée de ATCG (quelques exemples)
  3. Éprouver qu'une grande partie du génome n'est pas constituée de gènes
  4. Éprouver que beaucoup de gènes codant pour les protéines sont constitués d'Introns et d'Exons
  5. Éprouver que la limite introns-exons n'est pas discernable aisément
  6. Éprouver que l'origine de transcription est une séquence de bases
  7. Éprouver que les SNP sont fréquents et sont des changements d'une seule base par exemple dans le gène CFTR
  8. Savoir choisir les sondes pour déterminer chaque SNP étudié dans une puce à ADN (µ-array)
  9. Éprouver comment on pourrait choisir les sondes pour déterminer un SNP spécifique dans une puce à ADN (µ-array)
    1. Eprouver comment un SNP (mutation ∂F508) est la cause la plus fréquente de mucoviscidose)
  10. Estimer la taille minimale permettant de retrouver spécifiquement une séquence.
  11. Éprouver que les séquences pour les empreintes (satellites) sont des séquences répétées
  12. Comparer pour 3 personnes le nombre de répétitions dans un satellite  sur le chr 1
  13. Variante  Former un schéma du gel pour  une empreinte ADN à partir des séquences sur le chromosome 1 pour 3 personnes
  14. Éprouver que l'extrémité des chromosomes humains sont constitués de télomères
  15. Déterminer les tissus et organes exprimant un gène (humain) donné
  16. Déterminer le degré d'expression d'un gène selon les organes au cours de l'embryogenèse (souris)
  17. Preuve de l'évolution par la comparaison de protéines chez différentes espèces
  18. Etablir l'alignement et une phylogénie
  19. Trouver la date de divergence évolutive de deux espèces
  20. Déterminer la structure 3D d'une protéine biologiquement importante
  21. Convertir la structure de la protéine en fichier pour imprimante 3D(.STL)
  22. Éprouver le lien entre structure, séquence et fonction d'une protéine
  23. Peut-on prédire la répartition des espèces végétales à partir de mesures physicochimiques et des valeurs écologiques Landolt ? (et réciproquement ?)
  24. Éprouver le rôle central des protéines dans le fonctionnement normal et la maladie
  25. Trouver des séquences virales dans le génome humain
Des exemples d'insertions possibles dans les programmes
Activités et ressources proposées par le SIB Institut Suisse de Bioinformatique
Glossaire
Des liens vers des sources d'information
UniProtKB (SwissProt) http://uniprot.org/ Séquences de protéines
GDV genome Data viewer (Ex MapViewer)   https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/gdv/ Localisation des gènes sur les chromosomesm exploration des séquences codantes ou non
OMIM https://www.ncbi.nlm.nih.gov/omim Information sur les gènes et les maladies génétiques humaines.
PubMed https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/ Literature references (accède à la base Medline)
BookShelf https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books Des ouvrages de haute qualité gratuitement accessibles on-line
HMGD http://www.hgmd.cf.ac.uk/ac/index.php Human Genome Mutation Database
PDB http://www.rcsb.org/pdb/ Protein structures ->3-d
BLAST (NCBI) https://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi Recherche de similarité de séquences
BLAT (UCSC) http://genome.ucsc.edu/cgi-bin/hgBlat?command=start Recherche de séquences dans différents génomes (inclu humain). Plus rapide que Blast
Genetic Home Reference http://ghr.nlm.nih.gov/ghr/ Portail destiné au public : infos à propos des maladies génétiques
Genes and diseases https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK22183/ Ouvrage sur les Maladies humaines, mutations,…Informations concises et fiables.
Phylodendron http://iubioarchive.bio.net/treeapp/treeprint-form.html Logiciel on-line de visionnement d'arbres = cladogrammes
Timetree http://www.timetree.org/ Trouver la date de divergence entre deux espèces ( nom latin)
Bioinformatics @ NCBI https://www.ncbi.nlm.nih.gov/guide/all/ Toutes les banques de données du NIH en anglais
Digital world Biology http://digitalworldbiology.com/ Veut aider à mieux utiliser les outils BIST : Notamment

Tutorials sur Le BLAST, Entrez, Cn3D, etc