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* [[Séquence du gène de protéines sur chromosomes|Les gènes sont des séquences sur les chromosomes humains]] | |||
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* | * [[Séquence gène constituée ATCG|La séquence]] des gènes est constituée de ATCG | ||
* | * [[Génome pas constitué de gènes seulement|Une grande partie du génome n'est pas constituée de gènes]] | ||
* | * [[Gènes constitués d'Introns et d'Exons|Beaucoup de gènes sont constitués d'Introns et d'Exons]] | ||
* | * [[Limite introns-exons pas discernable|La limite introns-exons n'est pas discernable aisément]] | ||
* | * [[Éprouver que l'origine de réplication est une séquence de bases|L'origine de transcription est une séquence de bases]] | ||
* | * [[SNP fréquents - changements d'une seule base|Les SNP sont fréquents dans le génome humain]] | ||
* | * [[SNP fréquents - changements d'une seule base|Les SNP sont des changements d'une seule base]] | ||
* | * [[SNP fréquents - changements d'une seule base|On connait plusieurs mutations dans le gène CFTR]] | ||
* | * [[Choisir les sondes pour tester SNP sur micro-array|Les sondes déterminent quel SNP est testé dans une puce à ADN (µ-array)]] | ||
* | * Une sonde pour [[Choisir les sondes pour déterminer un SNP spécifique dans une puce à ADN (µ-array)|la mutation du gène CFTR ∂F508 (la plus fréquente) est détectable par une sonde pour puce à ADN (µ-array)]] | ||
* | * [[Estimer la taille minimale permettant de retrouver spécifiquement une séquence.|Estimer la taille minimale permettant de retrouver spécifiquement une séquence.]] | ||
* | * [[Les séquences pour les empreintes (satellites) sont des séquences répétées|Éprouver que les séquences pour les empreintes (satellites) sont des séquences répétées]] | ||
* | * [[Comparer pour 3 personnes le nombre de répétitions dans un satellite sur le chr 1]] | ||
* | * [[Former un schéma du gel pour une empreinte ADN à partir des séquences répétées|Variante Former un schéma du gel pour une empreinte ADN à partir des séquences sur le chromosome 1 pour 3 personnes]] | ||
* | * [[L'extrémité des chromosomes constitués de télomères|Éprouver que l'extrémité des chromosomes humains sont constitués de télomères]] | ||
* | * [[Preuve de l'évolution par la comparaison de protéines chez différentes espèces]] | ||
* | * [[Déterminer la structure 3D d'une protéine biologiquement importante|Déterminer la structure 3D d'une protéine biologiquement importante]] | ||
* | * [http://tecfa.unige.ch/perso/lombardf/formcont/proteines-3D/exemples-pdb-to-stl/ Liste de protéines sélectionnées, de structures 3D prêtes à imprimer] | ||
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* | * [[Convertir la structure de la protéine en fichier pour imprimante 3D]](.STL) | ||
* | * [[Éprouver le lien entre structure, séquence et fonction d'une protéine]] | ||
* [[Eprouver le rôle central des protéines dans le fonctionnement normal et la maladie|Éprouver le rôle central des protéines dans le fonctionnement normal et la maladie]] | |||
* Dans la discussion sur les OGM, montrer que le génome (humain aussi) est le résultat de nombreux échanges et pas étanche aux ADN étrangers, ni seulement hérité verticalement. | |||
** On peut amorcer la discussion (situation-problème) en relevant que les gènes humains ne sont qu'environ 1.5% et les traces de virus 8-10%. Nous serions plus OGM que humains ?? Le génome porte des traces d'intégration de séquences diverses : p ex ce scénario [[Trouver des séquences virales dans le génome humain|des séquences virales dans le génome humain]] | |||
**Discuter de l'idée de pureté de la transmission héréditaire avant les OGM en observant que l'ADN porte d'innombrables traces de mutations [[SNP fréquents - changements d'une seule base|Éprouver que les SNP sont fréquents]] | |||
**La biodiversité génétique [[SNP fréquents - changements d'une seule base|les SNP sont fréquents - par exemple dans le gène CFTR]] | |||
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Version du 9 mars 2021 à 12:12
Génétique et biologie moléculaire : insertions possibles des activités de biologie numérique
- La séquence des gènes est constituée de ATCG
- Une grande partie du génome n'est pas constituée de gènes
- Beaucoup de gènes sont constitués d'Introns et d'Exons
- La limite introns-exons n'est pas discernable aisément
- L'origine de transcription est une séquence de bases
- Les SNP sont fréquents dans le génome humain
- Les SNP sont des changements d'une seule base
- On connait plusieurs mutations dans le gène CFTR
- Les sondes déterminent quel SNP est testé dans une puce à ADN (µ-array)
- Une sonde pour la mutation du gène CFTR ∂F508 (la plus fréquente) est détectable par une sonde pour puce à ADN (µ-array)
- Estimer la taille minimale permettant de retrouver spécifiquement une séquence.
- Éprouver que les séquences pour les empreintes (satellites) sont des séquences répétées
- Comparer pour 3 personnes le nombre de répétitions dans un satellite sur le chr 1
- Variante Former un schéma du gel pour une empreinte ADN à partir des séquences sur le chromosome 1 pour 3 personnes
- Éprouver que l'extrémité des chromosomes humains sont constitués de télomères
- Preuve de l'évolution par la comparaison de protéines chez différentes espèces
- Déterminer la structure 3D d'une protéine biologiquement importante
- Convertir la structure de la protéine en fichier pour imprimante 3D(.STL)
- Éprouver le lien entre structure, séquence et fonction d'une protéine
- Éprouver le rôle central des protéines dans le fonctionnement normal et la maladie
- Dans la discussion sur les OGM, montrer que le génome (humain aussi) est le résultat de nombreux échanges et pas étanche aux ADN étrangers, ni seulement hérité verticalement.
- On peut amorcer la discussion (situation-problème) en relevant que les gènes humains ne sont qu'environ 1.5% et les traces de virus 8-10%. Nous serions plus OGM que humains ?? Le génome porte des traces d'intégration de séquences diverses : p ex ce scénario des séquences virales dans le génome humain
- Discuter de l'idée de pureté de la transmission héréditaire avant les OGM en observant que l'ADN porte d'innombrables traces de mutations Éprouver que les SNP sont fréquents
- La biodiversité génétique les SNP sont fréquents - par exemple dans le gène CFTR