« Éprouver que l'origine de réplication est une séquence de bases » : différence entre les versions

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== Éprouver que l'origine de réplication est une séquence de bases ==
== Éprouver que l'origine de transcription (promoteur) est une séquence de bases ==


== Procédure ==
== Procédure ==
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* Choisir le deuxième exon (point rond dans la bande bleue) puis cliquer la flèche gauche pour visualiser la séquence juste avant  l'exon  
* Choisir le deuxième exon (point rond dans la bande bleue) puis cliquer la flèche gauche pour visualiser la séquence juste avant  l'exon  
* [[Fichier:Tata-box-DLK1-in-GDV-hihglight.jpg|alt=Une TATA-box -  encadrée-  sur le gène DLK1 du Chr 14 visualisée dans GDV|vignette|Une TATA-box -  encadrée-  sur le gène DLK1 du Chr 14 visualisée dans GDV]]on voit de 22 à 18 bases avant l'exon la séquence TATA  [https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/953768433?report=graph&tracks=[key:sequence_track,name:Sequence,display_name:Sequence,id:STD649220238,annots:Sequence,ShowLabel:true,shown:true,order:1][key:gene_model_track,name:Genes,display_name:Genes,id:STD3194982005,annots:Unnamed,Options:MergeAll,CDSProductFeats:false,NtRuler:true,AaRuler:true,HighlightMode:2,ShowLabel:true,shown:true,order:4][key:alignment_track,name:UCActQAdsA4A2,display_name:(U)%20%20%20%20%20%20%20%20BLAST%20Results%20for\:%20Nucleotide%20Sequence,id:UCActQAdsA4A2,data_key:12RNvctmFL-4SFq4m1lsRjzi1ziISYZMikqiXLZYpHY1R_eB1rvQvZvDri_uv3LCI9p-zmDqO-989Wj4bv5i5VDMbcJB_ms,dbname:NetCache,annots:BLAST%20%20%20%20%20%20%20%20Results%20for\:%20Nucleotide%20Sequence Afficher cette zone du gène]
*[[Fichier:Tata-box-DLK1-in-GDV-hihglight.jpg|alt=Une TATA-box -  encadrée-  sur le gène DLK1 du Chr 14 visualisée dans GDV|vignette|Une TATA-box -  encadrée-  sur le gène DLK1 du Chr 14 visualisée dans GDV]]on voit de 22 à 18 bases avant l'exon la séquence TATA  [https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/gdv/browser/genome/?cfg=NCID_1_30376667_130.14.18.128_9146_1664177684_2445525965 Afficher cette zone du gène] <small>valable 90 jours depuis le 25 09 22</small>
NB : Cette région appelée ''''promoteur'''<nowiki/>' est importa<nowiki/>nte pour la régulation de l'expression du gène (transcription).


== ''Ce qu'on peut obtenir :  p. ex,  synthèse par un élève des résultats avec une classe ''  ==
== ''Ce qu'on peut obtenir :  p. ex,  synthèse par un élève des résultats avec une classe ''  ==


== Scénarios pédagogiques où il peut s'intégrer ==
== Scénarios pédagogiques où il peut s'intégrer ==
Pourrait suivre
* [[Séquence gène constituée ATCG|Éprouver que la séquence]] des gènes codant pour les protéines est bien constituée de ATCG (quelques exemples)
* [[Génome pas constitué de gènes seulement|Éprouver qu'une grande partie du génome n'est pas constituée de gènes]]
* [[Gènes constitués d'Introns et d'Exons|Éprouver que beaucoup de gènes sont constitués d'Introns et d'Exons]]
* [[Limite introns-exons pas discernable|Éprouver que la limite introns-exons n'est pas discernable aisément]]
*
===== Références =====
Scénario établi en partie sur la base des indications scientifiques de M.-C. Blatter du SIB


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[[Catégorie: BioInfoScenarios]]
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Dernière version du 26 septembre 2022 à 08:37

Éprouver que l'origine de transcription (promoteur) est une séquence de bases

Procédure

  • Ouvrir Genome data Viewer GDV ici
tata-box-hihlighted-in-DLK1-chr14-in-GDV.jpg
  • Chercher le gène DLK1 (suivre ce scénario) on le trouve sur le Chr 14.
  • Choisir le deuxième exon (point rond dans la bande bleue) puis cliquer la flèche gauche pour visualiser la séquence juste avant l'exon
  • Une TATA-box - encadrée- sur le gène DLK1 du Chr 14 visualisée dans GDV
    Une TATA-box - encadrée- sur le gène DLK1 du Chr 14 visualisée dans GDV
    on voit de 22 à 18 bases avant l'exon la séquence TATA Afficher cette zone du gène valable 90 jours depuis le 25 09 22

NB : Cette région appelée 'promoteur' est importante pour la régulation de l'expression du gène (transcription).

Ce qu'on peut obtenir : p. ex, synthèse par un élève des résultats avec une classe

Scénarios pédagogiques où il peut s'intégrer

Pourrait suivre

Références

Scénario établi en partie sur la base des indications scientifiques de M.-C. Blatter du SIB

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