« Éprouver que l'origine de réplication est une séquence de bases » : différence entre les versions

De EduTech Wiki
Aller à la navigation Aller à la recherche
(Création de la page)
 
Ligne 3 : Ligne 3 :
== Procédure ==
== Procédure ==
Ouvrir Genome data Viewer GDV [https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/gdv/ ici]
Ouvrir Genome data Viewer GDV [https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/gdv/ ici]
Chercher le gène DLK1 (suivre [[Éprouver que la séquence du gène de quelques protéines est repérable sur les chromosomes humains.|ce scénario]]) on le trouve sur le Chr 14. 
Choisir le deuxième exon (point rond dans la bande bleue) puis cliquer la flèche gauche pour visualiser la séquence juste avant  l'exon on voit de 22 à 18 bases avant l'exon la séquence TATA  [https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/953768433?report=graph&tracks=[key:sequence_track,name:Sequence,display_name:Sequence,id:STD649220238,annots:Sequence,ShowLabel:true,shown:true,order:1][key:gene_model_track,name:Genes,display_name:Genes,id:STD3194982005,annots:Unnamed,Options:MergeAll,CDSProductFeats:false,NtRuler:true,AaRuler:true,HighlightMode:2,ShowLabel:true,shown:true,order:4][key:alignment_track,name:UCActQAdsA4A2,display_name:(U)%20%20%20%20%20%20%20%20BLAST%20Results%20for\:%20Nucleotide%20Sequence,id:UCActQAdsA4A2,data_key:12RNvctmFL-4SFq4m1lsRjzi1ziISYZMikqiXLZYpHY1R_eB1rvQvZvDri_uv3LCI9p-zmDqO-989Wj4bv5i5VDMbcJB_ms,dbname:NetCache,annots:BLAST%20%20%20%20%20%20%20%20Results%20for\:%20Nucleotide%20Sequence Afficher cette zone du gène] 
[[Fichier:Tata-box-hihlighted-in-DLK1-chr14-in-GDV.jpg|vignette|tata-box-hihlighted-in-DLK1-chr14-in-GDV.jpg]]
[[Fichier:Tata-box-hihlighted-in-DLK1-chr14-in-GDV.jpg|vignette|tata-box-hihlighted-in-DLK1-chr14-in-GDV.jpg]]



Version du 5 octobre 2020 à 18:13

Éprouver que l'origine de réplication est une séquence de bases

Procédure

Ouvrir Genome data Viewer GDV ici

Chercher le gène DLK1 (suivre ce scénario) on le trouve sur le Chr 14.

Choisir le deuxième exon (point rond dans la bande bleue) puis cliquer la flèche gauche pour visualiser la séquence juste avant l'exon on voit de 22 à 18 bases avant l'exon la séquence TATA Afficher cette zone du gène

tata-box-hihlighted-in-DLK1-chr14-in-GDV.jpg

Ce qu'on peut obtenir : p. ex, synthèse par un élève des résultats avec une classe

Scénarios pédagogiques où il peut s'intégrer

Retour à Bioinformatique : opportunités pour l’enseignement