Chromosome 2
Caractéristiques
- Taille: 8.1 cm
- Nombre de paires de base: 242'951'149 pb
- Nombre estimé de gènes: 1400 gènes
- Lieux de séquence: Allemagne et USA
- Divers: Ce chromosome est issu de la fusion de deux chromosomes hérités de nos ancêtres primates; le chimpanzé, lui, a conservé les deux exemplaires ancestraux du chromosome.
Gènes
Gène 1: impliqué dans la préférence de l'usage de la main droite ou de la main gauche.
Gène 2: codant pour la titine, la plus grande protéine humaine.
Gène 3: impliqué dans le développement des muscles.
Gène 4: impliqué dans le battement de notre cœur.
Concepts généraux
Porte le gène de la plus grande protéine: La titine
- en moyenne une protéine se compose de 300 acides aminés; la titine en a 34'350!
- a une région qui se répète 132 fois! Cette région a une fonction précise: elle "s'accroche" à d'autres protéines essentielles à la contraction musculaire.
- autre fragment d'une région répétée six fois et qui représente le cinquantième de la longueur totale de la protéine.
Titine et bioinformatique
- portrait-robot: protéine trop grande pour en dresser un portrait-robot!
- rôle du portrait-robot: donne une idée du rôle que pourrait avoir une protéine dans l'organisme. Il n'est donc que hypothétique et doit toujours être vérifié par le chercheur.
Questions-réponses
Qu'est-ce qu'une protéine ?
La protéine est l'une des molécules les plus importantes existant dans tout les êtres vivants et même dans les virus.
vous devez donner une meilleure définition de ce que sont les protéines... avec peut-être quelques exemples concrets: insuline, hormone de croissance, anticorps, collagène, etc...Pierre.brawand 2 novembre 2008 à 11:35 (MET)
Cette macromolécule est composée d'un ou de plusieurs chaînes d'acides aminés.Ceux-ci sont liés par une liaison peptidique. De plus nous disons qu'une molécule est une protéine lorsqu'elle est formée par plus de 50 acides aminés. L'enchaînement des acides aminés constituant la protéine est codé par un génome (dans notre cas, le génome 2 constitue la tiroïde.) contenu dans un gène.
Elle a pour fonctions d'assurer l'essentiel des fonctions de la cellule:
- Catalyse
- Transport
- Communication
- Signalisation
- Reconnaissance
- Structure
Nous pouvons trouver les protéines sous diverses formes telles que:
- hormones
- enzymes
- récepteurs
- neurotransmetteurs
Vous pouvez avoir de plus amples informations sur la formation d'une protéine avec le chromosome 5.
Qu'est-ce qu'un acide aminé ?
Un acide aminé est une molécule organique et la base d'une protéine. Il mesure environ 100 picomètres (pm). En tout, il existe 20 acides aminés. Nos protéines sont donc formées de 20 acides aminés. attention, c'est phrase prète à confusion: une protéine est formée AVEC ces 20 acides aminés... mais vous ne pouvez pas dire qu'une protéine est formeé de 20 acides aminés... car peut-être qu'elle contera 250 aa... OKPierre.brawand 2 novembre 2008 à 11:35 (MET)
Cependant notre corps ne peut pas produire ses propres acides aminés, c'est pourquoi nous devons manger des aliments dans lesquels nous pouvons en trouver. Notre corps cassera alors les liaisons peptidiques entre elles et reprendra chaque acide aminé pour ensuite former des protéines.
pensez peut-être à montrer les acides aminés et leur liaison pour former une protéine (cf. Campbell)Pierre.brawand 2 novembre 2008 à 11:35 (MET)
Quelle est la taille des protéines chez l'Homme ?
La taille de la protéine chez l'homme est très variable, elle se constitue en moyenne de 300 acides aminés. Cependant il y a une grosse exception: la titine, qui est formée de 34'350 acides aminés !
Structure répétitive?
Quel est le rôle de la Titine ?
Lorsque nous faisons des efforts physiques, comme par exemple courir ou sauter, celle-ci agit au coeur de nos cellules musculaires. La titine a pour fonction de maintenir la structure cellulaire des muscles lorsque qu'elle est soumise à rude épreuve par les contractions et étirements répétés ?tout en longeur et très flexible?.
pour plus d'informations sur la Titine: [1]Pierre.brawand 2 novembre 2008 à 11:37 (MET)
En quoi un portrait robot est-il si important ?
Un protrait-robot a pour fonction de nous donner des informations sur une certaine protéine telles que:
- donne des estimations du poids d'une protéine et sa durée de vie dans une cellule.
- prédit la forme de la protéine
- détermine des régions uniques de la protéine qui se repèteraient.
Toutes ces informations sont donc importantes afin d'aider les chercheurs à comprendre les protéines. Chez la titine, ils ont pu découvrir une région de la protéine qui se répète 132 fois. Cette région a pour fonction de s'attacher à d'autres protéines importantes à la contraction musculaire.
Relation entre taille des protéines et bioinformatique?
difficulté à définir la protéine à l'aide de la bioinformatique.
Un crash informatique ! La dimension gigantesque de la titine a donné du fil à retordre aux bioinformaticiens. Pourquoi ? Lorsqu’on a voulu en dresser une sorte de portrait-robot, les programmes informatiques existants - conçus pour analyser des protéines de taille ‘standard’ - étaient incapables de gérer une aussi grande protéine. Et lorsqu’on introduisait la titine dans ces programmes, ils ‘se plantaient’ tout simplement !
Un portrait-robot pour une protéine ? A quoi peut bien servir le portrait-robot d’une protéine ? Il donne une idée du rôle que pourrait avoir une protéine dans l’organisme. Comme tout portrait-robot, celui d'une protéine est hypothétique et doit être vérifié par le chercheur en laboratoire.
Un exemple ? Le portrait-robot donne une estimation du poids d’une protéine et de sa durée de vie dans une cellule. Il peut aussi prédire sa forme, présumer de son interaction avec d’autres protéines ou encore identifier des régions uniques comme des régions qui se répètent. Tous ces indices sont capitaux pour orienter le chercheur dans ses travaux. Dans le cas de la titine, ces programmes ont déterminé une région qui se répète pas moins de 132 fois ! Cette région a une fonction précise : elle "s’accroche" à d’autres protéines essentielles à la contraction musculaire.
Longue vie aux muscles ! Tandis que nous courons ou sautons, la titine œuvre au cœur des cellules musculaires. Tout en longueur et très flexible, elle maintient l’architecture des cellules musculaires, soumises à rude épreuve par les contractions et étirements répétés.
Conclusion
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