Chromosome 19
chromosome 19
- Longueur de l'ADN: 63'811'651 pb soit 2.1 cm
- Nombre éstimé de gènes: 1'500
- Séquencé : aux USA
- Particularité: Le chromosome 19 est le chromosome humain le plus dense en gènes.
Concepts développés par le poster
- toute première cellule = zygote
- divison cellulaire = segmentation
- spécialisation des cellules: on parlera plutôt ici de DIFFERENTIATION et donc de spécialisation
- Concept de "protéomique": c'est quoi? son utilité?
- carte géographique des protéines: 2D gel = l’électrophorèse bidimensionnelle
Qu'est-ce qu'une cellule?
C'est l'unité structurale et fonctionnelle fondamentale de la vie. Le corps humain possède de nombreux types de cellules qui présentent différents caractères.La cellule contient les éléments principaux lui permettant de fonctionner.
Qu'est ce que le zygote et comment fonctionne -il?
Le zygote (= cellule oeuf), est la toute première cellule diploïde d'un individu, elle a donc tout le matériel génétique nécessaire à l'édification et au maintien de l'être vivant. Le zygote (diploïde = 2n) est le résultat de la fusion (=fécondation) d'un gamète mâle haploïde (1n) et d'un gamète femelle haploïde (1n). 1n + 1n = 2n
Quelque soit le cycle de développement de l'espèce, l'oeuf sera toujours diploïde (sauf exceptions...). Le zygote se divise en deux copies identiques qui se re-divisent en deux autres parties identiques et ainsi de suite (= segmentation).
Que devienne ces cellules divisés?
On aura donc plusieurs types de cellules qui vont se différencier, entres autres, en cellules musculaires,nerveuses etc..
Est-ce que ces cellules contiennent les mêmes gènes?
Oui, mais à un certain stade embryonnaire, elles vont se spécialiser en n’utilisant que les gènes dont elles ont besoin.
Ces cellules donnent ont toutes une structure et une fonction propres.
Par exemple:
- La plupart des animaux possèdent des cellules musculaires qui leur permettent de se déplacer, ainsi que des neurones (cellules nerveuses) qui transmettent des stimulus aux cellules
- les végétaux possèdent les cellules du mésophylle qui effectuent la photosynthèse, et les cellules stomatiques autour des stomates (pores) régissent la circulation d'air entre l'intérieur et l'extérieur des feuilles.
Comment fait-on pour définir des différence entre ces lignées cellulaires.?
Tout d'abord, au cours d'un développement embryonnaire, les cellules, tout en se multipliant subissent une différenciation cellulaire; c'est le processus par lequel elles acquiert des structures et des fonctions spécialisées.Les cellules de différents types ne sont pas distribués par hasard:elles sont groupées en tissus et en organes.La morphogénèse (ensmemble des mécanismes physique déterminant la forme de l'organisme)s'en occupera ensuite.
Ce qui crée plusieurs ou même de nombreux types de cellules différenciées.
Le développement embryonnaire conduit, à partir d'une cellule unique (oeuf fécondé ou zygote), à l'apparition de plusieurs lignées de cellules différant par leur forme, leur position, et leur fonction.
Chez l'embryon, la différenciation de cellule et la morphogénèse sont couplées; de ce couple résulte la formation des tissus et des organes.
Les événements de différenciation se produisent dans le temps et l'espace, selon un schéma hautement organisé invariable pour une espèce donnée.
Après les étapes de division et d'élongation, les cellules vont se différencier, c'est à dire se modifier structurellement en se spécialisant physiologiquement.
Les différences entre les types de cellules ne sont pas attribuables à la présence de différents gènes, mais plutôt à l'expression génique différentielle, c'est-à-dire à l'expression de gènes différents par des cellules dont le génome est identique.
Pour définir des différences entre ces lignées cellulaires on peut soit :
- observer l'expression génique différentielle, soit l'expression de gènes différents par des cellules dont le génome est identique.
- observer les étapes principales de l'expression d'un gène codant pour une protéine, soit la production des protéines.
ça sent un peu le copy-paste...Pierre.brawand 30 octobre 2008 à 22:55 (MET)
Qu'est-ce que l'analyse protéomique?
La protéomique s’intéresse à l’étude du protéome, c’est-à-dire à l’ensemble des protéines constituant un compartiment cellulaire (ex: les protéines nucléaires), une cellule, un tissu ou un organisme vivant entier.
Elle permet notamment :
- La recherche et l'’identification systématique de l ’ensemble des protéines constituant un organisme, un tissu…
- L’identification des protéines constituant un complexe protéique (interactions protéines-protéines)
- La recherche et l ’identification de protéines impliquées dans des voies de signalisation par exemple par une analyse différentielle (sauvage/mutant).
Qu'est-ce que l’électrophorèse bidimensionnelle ?
L'électrophorèse bidimensionnelle permet à partir de mélanges protéiques complexes de pouvoir visualiser des centaines voire des milliers de protéines sous forme de taches ou « spots ». L'image obtenue est suffisante pour mettre en évidence la présence d'isoformes. Elle se déroule en deux étapes:
- Elle effectue une séparation des protéines en fonction de leur charge (isoélectrofocalisation, IEF, La résolution que l'on peut attendre de la séparation en première dimension est de l'ordre de 0.01 unités pH et peut être améliorée par l’utilisation d’une zone de point isoélectrique plus étroite.
- La deuxième séparation s'effectue à 90° par rapport à la première, en fonction de la taille moléculaire. Ici, l'isoélectrofocalisation est suivie d'une séparation selon un critère de taille, par une méthode classique d'électrophorèse en gel d'acrylamide en présence d’un détergent ionique, le SDS.
Les gels obtenus sont par la suite colorés puis numérisés. Souvent, il n'est pas nécessaire de mesurer la quantité absolue de protéine présente, mais de comparer l'abondance relative des protéines dans deux situations. C'est pourquoi, la quantification des protéines est le plus souvent réalisée en comparant les intensités de coloration de protéines séparées par électrophorèse. La détection par des anticorps après transfert des protéines sur une membrane semi-rigide présente également un intérêt, bien que seulement semi-quantitative.
Pour finir, on peut faire un lien entre la protéomique ainsi que la différenciation cellulaire. En effet, on peut grâce à la technique de la protéomique différencier les différentes lignées de cellules. On peut soit observer l'activation de certains gènes, soit regarder la production des protéines pour pouvoir comprendre chaque protéines à quoi elle sert et vice versa. vous DEVEZ ABSOLUMENT développer un maximum cette dernière phrase en donnant par exemple des exemples plus concrets.... c'est la clé de votre présentation.... mais sinon ça va!Pierre.brawand 30 octobre 2008 à 22:57 (MET)
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