Régulation génique 3BIOS01 2023
18.1 Les bactéries s’adaptent souvent aux fluctuations de leur milieu en régulant la transcription
ch18 - Campbell 9e éd. - pp407-412
Dans le cadre de l’étude de la régulation de l’expression génique, vous répondrez par groupes de deux à toutes les questions indépendamment des réponses qui seront déjà inscrites par les autres élèves de la classe.
Dans un deuxième temps, chaque groupe définira en choisissant parmi les réponses données la réponse définitive qui restera dans le document final.
Dans un troisième temps, une fois le document imprimé, vous organiserez une discussion en classe pour renforcer les connaissances et s'assurer que les points ont bien été compris.
Questions:
Définissez le concept d’adaptabilité chez les bactéries.
Le concept d'adaptabilité est due a la régulation au niveau de la transcription.
Les Bactéries s'adaptent en fonction de son environnement pour favoriser leur approvisionnement, la modification de l'expression génétique sera donc importante.
Pour obtenir ces ressources, elles ont besoin d'enzymes pour effectuer la synthèse de ces derniers.
Pour ce faire, elles possèdent une capacité à réguler la production de certaines enzymes.
(Le mode régulation concerne aussi les enzymes qui sont déjà présentes dans les bactéries. )
Les cellules activent en cas d'insuffisance ou au contraire désactivent.. le gène
5 novembre 2023 à 14:20 (CET)Malisha
Expliquez pourquoi la sélection naturelle a favorisé les Bactéries qui n’expriment que les gènes dont les produits sont nécessaires à la cellule ?
Le milieu d'une bactérie comme E. coli est extrêmement variable. Cette bactérie a besoin d'un acide aminé appelée tryptophane pour survivre, sauf que cet acide aminé n'est pas constamment présent dans le milieu.
Les Bactéries qui n'expriment pas uniquement les gènes dont les produits sont nécessaires à la cellule risquent de mourir face au manque de leur acide aminé vital, synthétisant d'autres gènes non essentiels qui ne comblent pas le manque tryptophane nécessaire à la cellule.
La bactérie dépend moins de l'hôte si elle ne synthétise que les gènes dont les produits sont nécessaires à la cellule, c'est donc un avantage qui permet de mieux survivre aux changements du milieu, expliquant pourquoi la sélection naturelle a favorisé les Bactéries qui n’expriment que les gènes dont les produits sont nécessaires à la cellule.
(fini)
LukaP (discussion) 30 octobre 2023 à 09:25 (CET)
AntonG (discussion) 30 octobre 2023 à 09:04 (CET)
Quelles sont les deux voies de régulation de l’expression génique ?
On a deux voies : la voie anabolique (de biosynthèse) et la voie catabolique. JoaoPedroR (discussion) 8 novembre 2023 à 20:09 (CET)
Quelles sont les différences fondamentales entre ces deux voies de régulation ?
l'un va agir par voie anabolique (exemple : rétro-inhibition) donc par accumulation de co-répresseur dans l'organisme agissant ainsi sur la production d'enzymes. L'autre agit sur les molécules qui catalysent la synthèse en arrêtant leur production. DianeM (discussion) 8 novembre 2023 à 20:21 (CET) et JoaoPedroR (discussion) 8 novembre 2023 à 20:21 (CET)
Décrivez le modèle de l’opéron.
fgdrdrsArtusB (discussion) 30 octobre 2023 à 09:27 (CET)
Définissez les termes suivants :
opérateur:
Un opérateur est un segment d'ADN qui peut se lier à une protéine régulatrice, ce dernier permet la régulation de la transcription de l'ADN. La liaison de la protéine régulatrice à l'opérateur est souvent modulée par un signal externe. Cette dernière peut moduler l'expression des gènes en aval, C'est pourquoi l'opérateur est une partie d'opéron.
La liaison de cette protéine à l'opérateur peut réguler la production du produit du gène ainsi contrôlé de deux façons différentes…
- Soit elle permet d'actionner la production du gêne contrôlé et on parle d'activateur
- Soit elle permet de ralentir ou d'arrêter la production du gêne contrôlé et on parle alors de répresseur
Il existe aussi des opérateur traductionnel qui sont présents sur une séquence d'ARN. Par conséquent, il permet la régulation de la transcription que au niveau de l'ARNm.
HugoB (discussion) 30 octobre 2023 à 08:51 (CET)
répresseur:
Le répresseur est une protéine qui va inactiver l'opéron. Il va se lier à l'opérateur empêchant l'alliage entre de l'ARN polymérase au promoteur, de ce fait la transcription des gènes ne sera plus possible.DianeM (discussion) 30 octobre 2023 à 09:09 (CET)
inducteur:
L'inducteur est une petite molécule précise qui active le répresseur.HakimA (discussion) 30 octobre 2023 à 09:12 (CET) L'inducteur est une petite molécules qui va inactivé le répresseur.
activateur:
Un activateur est une protéine régulatrice qui en se liant à l'ADN stimule la transcription d'un gène. FINI . DianeM (discussion) 30 octobre 2023 à 09:21 (CET)
molécule allostérique:
InesSB (discussion)
Lorsqu'il y a une présence de lactose,
Quelles sont les différences entre un opéron répressible et un opéron inductible ?
Un opéron répressible est un opéron qui est habituellement actif, il peut donc transcrire les gènes. Cependant, il peut être inhibé (répression), à tout moment, lorsqu'une petite molécule spécifique se lie par une liaison allostérique à une protéine régulatrice.
Un opéron inductible est habituellement inactif, mais il peut être stimulé (induction) grâce à l'interaction entre une petite molécule spécifique et une protéine régulatrice.
EvaBS (discussion) 30 octobre 2023 à 09:12 (CET)
Quelles sont les différences entre une régulation génique négative et une régulation génique positive ?
La régulation génique négative a pour but d'empêcher la transcription de l'ADN.
La régulation génique positive a pour but d'activer la transcription de l'ADN. Les activateurs comme le AMPc font partis de cette régulation. JoaoPedroR (discussion) 8 novembre 2023 à 20:29 (CET)
Comment la bactérie régule l’expression de l’opéron lac quand le glucose et le lactose sont rares ?
GeodricT (discussion) 30 octobre 2023 à 09:30 (CET)
Comment la bactérie adapte-t-elle son métabolisme lorsque le milieu contient du lactose et peu de glucose ?
Lorsqu'il n'y a que peu de glucose, un allolactose vient se fixer à la protéine répresseur afin de le désactiver. Ceci va permettre à l'opéron de s'activer et donc transcrire les trois enzymes inductibles. Une grande quantité d'AMPc s'attache à la protéine CAP, ce qui l'active. Cette dernière se lie à l'ARN polymérase afin de venir produire beaucoup d'ARNm, stimulant l'expression génique, qui vont elles mêmes synthétiser les enzymes lac.
MartinM (discussion) 30 octobre 2023 à 08:56 (CET)
Comment la bactérie adapte-t-elle son métabolisme lorsque le milieu contient du lactose et du glucose ?
Lorsqu'il y a à la fois du glucose et de lactose, la bactérie consomme en priorité le glucose. Elle va donc produire moins d'AMPc et la protéine CAP ne s'active pas. De ce fait, l'ARN polymérase, n'étant pas liée a la protéine CAP, sera moins susceptible de s'attacher au promoteur. Donc, moins d'ARNm est produit, ce qui synthétisera moins d'enzymes.
ElouanL (discussion) 30 octobre 2023 à 09:23 (CET)
Émettez une hypothèse concernant la raison, pour la bactérie, de privilégier le glucose au lactose ?
La bactérie E.coli doit d'abord catalyser le lactose pour obtenir du glucose ce qui demande de l'énergie. Elle peut cependant économiser celle-ci si elle obtient directement le glucose. JoaoPedroR (discussion) 30 octobre 2023 à 09:26 (CET)
Quel est l’intérêt pour la bactérie de réguler plus de 100 gènes avec la protéine CAP?
La bactérie produit facilement du glucose grâce à des enzymes qui le catalyse et de ce fait dans un milieu riche en glucose la protéine CAP se retrouve inactive. Toutefois, la cellule peut également survivre sans glucose en synthétisant d'autres composés (exemple : lactose) grâce à cette protéine. La bactérie optimise donc son gain d'énergie avec l'appui de la protéine CAP. Cette dernière favorise la production de divers composés utile à sa survie et elle peut favoriser et/ ou empêcher la production de certains composé selon le milieu dans lequel elle se trouve. DianeM (discussion) 8 novembre 2023 à 20:40 (CET) et JoaoPedroR (discussion) 8 novembre 2023 à 20:40 (CET)
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