Labo Phylogénie moléculaire 13/14

Comparaison de séquences protéiques chez différents animaux.

INTRODUCTION :
Ces travaux pratiques ont pour but de comparer des séquences de protéines pour obtenir des informations sur l’histoire évolutive de différents organismes et notamment sur leurs liens phylogénétiques. Cette analyse permettra de produire des arbres phylogénétiques rendant compte de la relation de parenté entre ces différents organismes.

CADRE THEORIQUE :
On peut représenter l'histoire évolutive d'un groupe d'organismes dans un diagramme arborescent appelé arbre phylogénétique. L’arbre phylogénétique représente des liens évolutifs hypothétiques. Ces liens sont souvent présentés selon un modèle dichotomique, c'est-à-dire au moyen d'une série de fourches à deux branches. Chaque point de bifurcation (ou nœud) correspond à la divergence de deux lignées issues d'un ancêtre commun. Les trois points clés de l'arbre phylogénétique sont  : • Premièrement, cette représentation vise à montrer des modèles de descendance et non des ressemblances phénotypiques. Bien qu'il soit fréquent que des organismes parents se ressemblent en raison de leur ancêtre commun, il n'en sera pas de même si leur lignée respective n'a pas évolué au même rythme ou s'ils ont dû composer avec des conditions environnementales très différentes. Par exemple, les Crocodiles sont plus proches des Oiseaux que des Lézards (voir la figure 22.17), mais ils ressemblent davantage à ces derniers parce que la morphologie de la lignée des Oiseaux a considérablement changé.