« Approche moléculaire » : différence entre les versions
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Version du 24 février 2008 à 23:05
Sites utilisés :
Uniprot : Obtention des séquences de protéines
Clustal W : Comparaison des séquences
Phylodendron : Construction des arbres phylogénétiques.
Wikipédia Encyclopédie libre
Marche à suivre
- Avec l’aide de l’encyclopédie Wikipédia, sélectionner un organisme par embranchement (Exemple : Pieuvre).
- Obtenir le Genre (Octopus).
- Copier cette information.
- Ouvrir le site Uniprot. Choisir dans le menu search in Taxonomy.
- Dans Query coller le genre de l’organisme choisi.
- Choisir les résultats possédant une étoile et les organismes les plus communs (Octopus vulgaris).
- Sélectionner UniProtKB.
- Dans Query ajouter à taxonomy:6645 AND Cytochrome c oxidase subunit 1 ou COl.
- Cliquer sur le numéro d’Accession.
- Cliquer sur le rectangle orange FASTA.
- Copier les séquences obtenues et coller dans le Bloc-Notes.
- Répéter les points 1 à 4 pour chaque organisme et coller à la suite les séquences obtenues dans le Bloc-Notes.
- Répéter les points 1 à 4 pour chaque organisme et coller à la suite les séquences obtenues dans le Bloc-Notes.
- Ouvrir le site Clustal W.
- Copier l'ensemble des données du Bloc-Notes (ctrl-A).
- Coller le tout dans le rectangle en bas de la page.
- Presser run.
- Dans le rectangle Results of search, sélectionnez Guide tree file.
- Copier la totalité de l'information.
- Ouvrir le site Phylodendron