« Approche moléculaire » : différence entre les versions
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[http://iubio.bio.indiana.edu/treeapp/treeprint-form.html Phylodendron] : Construction des arbres phylogénétiques.<br> | [http://iubio.bio.indiana.edu/treeapp/treeprint-form.html Phylodendron] : Construction des arbres phylogénétiques.<br> | ||
[http://fr.wikipedia.org/wiki/Accueil Wikipédia] Encyclopédie libre<br> | [http://fr.wikipedia.org/wiki/Accueil Wikipédia] Encyclopédie libre<br> | ||
==Marche à suivre== | |||
:#Avec l’aide de l’encyclopédie Wikipédia, sélectionner un organisme par embranchement (Exemple : Pieuvre). | |||
::Obtenir le Genre (Octopus). | |||
::Copier cette information. | |||
:#Ouvrir le site Uniprot. Choisir dans le menu search in Taxonomy. Dans Query coller le genre de l’organisme choisi. Choisir les résultats possédant une étoile et les organismes les plus communs (Octopus vulgaris). | |||
Sélectionner UniProtKB. | |||
Dans Query ajouter à taxonomy:6645 AND Cytochrome c oxidase subunit 1 ou COl. | |||
Cliquer sur le numéro d’Accession. | |||
Cliquer sur le rectangle orange FASTA. | |||
Copier les séquences obtenues et coller dans le Bloc-Notes. | |||
Répéter les points 1 à 4 pour chaque organisme et coller à la suite les séquences obtenues. | |||
Version du 24 février 2008 à 22:39
Sites utilisés :
Uniprot : Obtention des séquences de protéines
Clustal W : Comparaison des séquences
Phylodendron : Construction des arbres phylogénétiques.
Wikipédia Encyclopédie libre
Marche à suivre
- Avec l’aide de l’encyclopédie Wikipédia, sélectionner un organisme par embranchement (Exemple : Pieuvre).
- Obtenir le Genre (Octopus).
- Copier cette information.
- Ouvrir le site Uniprot. Choisir dans le menu search in Taxonomy. Dans Query coller le genre de l’organisme choisi. Choisir les résultats possédant une étoile et les organismes les plus communs (Octopus vulgaris).
Sélectionner UniProtKB. Dans Query ajouter à taxonomy:6645 AND Cytochrome c oxidase subunit 1 ou COl. Cliquer sur le numéro d’Accession.
Cliquer sur le rectangle orange FASTA. Copier les séquences obtenues et coller dans le Bloc-Notes.
Répéter les points 1 à 4 pour chaque organisme et coller à la suite les séquences obtenues.